Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT14490 chr2R 6109134–6111383 (2249 bp) Hr46, CG12912 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
head subset, ventral epidermis subset VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14not active0
15-16head subset3
15-16ventral epidermis subset3

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0000448Hr46overlapping BDGP FlyBase iFly
FBgn0033497CG12912overlapping BDGP FlyBase
FBgn0005619Hdc18203bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0085250CG3422121939bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0033498CG1220924442bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

cgcctgctgtacgctttttatgacacatgtgttacatacacaattcgtatctttgtatctttttatctgtggcagcagcgaagaaagggtctgcagccgtctctttcccgttctccgattgcctgccatttcgatttgaattagttgaattgtcaatgcaaaaaaaaaaaaaaagtcagcaagccactcgcacaaacaaacacaaacacacgcaagtgggtttcgtaatattcgttcggctgtctttcttcatttacgaatttcatggatttcccttaaatattttgtgttgctgttggccaagaaacccaagtgactttcactgccaggccagcgaaaacgcaaaaataacgaaaaagagcagtcagccagccactcatttcgggaccaactggctgactgactgactgactgactccgctctgccacataaaaccagcaacttaactggatttcattaagtttatactttatttcactgctttgtgcaattcccctgttgatttttgcgggatgaaagttcacacttgccgcttacttaacatgatgtcttgaaacatatgcaaaatggtctacaacttcctgaagaacgaaaaagggaactccccgtggtttgatgtatttcctgagatttgtatggtctcatattctaatagatctaaaagtatccgcttaaatttactattaatttcttataagtacttcttttacttattttttactttttctttttaaccagctttctacttcttaaaaccattttcattgaattttcgtagcttttttggtttgcagcattttatttattagaataatttgaaaggattgaaatattaatgatgctttacctttaatggaaccgctggagttgttttgtcccgccggcgattggacgttgctttgaccgagattgtttgcgtgtgcttccagtttcgaagtgacgctgctccacatgtcaaacatacgttgcgtatacataattattagtgggaaatgcgaagctttggtgacgtttcaaacgtttgccggtgctgttgctgatgttgttgccgctgccgttgattggtgaaatagttgcaattgtagctgtagttatgtacacttggtatcagttgatgcaaccgctgatgaacacgggcactcacaccgacggccatacgcggcgtatgcgcaatttggctgctctttgcagttgaatgaattcggttttcgcttagatcttagttttctttcttgtttgtaaatgtgtaaaacgttgtatacagtacttaatatatagatatatatatatatatatatatacactttatttagctgcccttcggttccaattgtattagccaatcgtcttattgcacttggtctttacttttcttttgtggcttgtgttttagctagtccgcagatgctttcgtgaatgaattttcagcgctttttagcattcagtgtgaatcaagaactatcacagtgtgtgtgggtgtttgtgagacggggggcgaggggcgttgtgagggggcttgccaatcgatatatatgtatatatatttgttttgtatattgctatatatctatatgtatgtatataatgatctaacgttgtcaggcctgtaggtactaaattgttgatgttgtttggatctgatgttatatgtggttgctgccgcttaattattgggtttccttattaattcgtttatcaaactatttgttaataagacacttgttcgcgtatgtattaaacttgtttagttatctatcgttatcgtttatttaaagcaattttctatgatttgataatatctatttaaatcgaacgttcaacgttttagcccttttgcagtaagtgcagattgttgcttttgctgctgctattgttattgctattgtagtttttgtttttggttgctttgggcagttgttgttgctgtagcttttgttgttgctgctgttttatcactttcactgcgttgttgttgttgttgctgctgctgctgctgctgctgctacggttgctgtgatttttattgtgttgcttgttggtgttgttgttgttgttgccgctgctgctgttggtttccttgttgttgctgctgctatgctcattgttttgtcgatttctctgttttgcttgattccaaatcaaaatttccaaaaatacgaaaatttcacgacaattaattccggaagacatttaggcgcaatctgtttctcatcgattcgaactgtcgctgccgtagaaacgttcatctg

PCR verification status

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