| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT14979 | chr2R 7083386–7085626 (2240 bp) | shn, CG9084 |
      active |
anterior midgut anlage, posterior midgut anlage, midgut broad | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | posterior endoderm AISN | 2 |
| 7-8 | posterior endoderm anlage | 3 |
| 7-8 | anterior endoderm anlage | 2 |
| 9-10 | anterior midgut anlage | 4 |
| 9-10 | posterior midgut anlage | 4 |
| 11-12 | anterior midgut primordium | 3 |
| 11-12 | posterior midgut primordium | 3 |
| 13-14 | midgut broad | 4 |
| 13-14 | ubiquitous | 2 |
| 15-16 | midgut broad | 3 |
| 15-16 | ubiquitous | 2 |
| 15-16 | midgut interstitial cell | 3 |
Whole-slide images
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0003396 | shn | overlapping | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0033582 | CG9084 | 21535bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0037084 | Syx6 | 23658bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0033579 | CG13229 | 23676bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0033584 | CG7737 | 26990bp upstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
cggaatcactgtccaatttcttttcgtgtacatttctacgcgtatgtagactcgtctacgtgtatatgtatgtatatacgtattgctttaatagatgagtgcgtaccactcgttctcgcttgattgtgtttattgattagattgtttacctttcttcgtgatatcatcggcgaccaagtgctgagcgttgttatcgtacgtcaactgtccaaataaatgtacatctgagcacacatcgaaaactattcctatggcatggaatatattgacacatacatacctatgtatgtatgtatgtatgatggattttccatattgagagcgcttgtgtggtgatagttcttatcgaatcgcttccgttcgatttggcacagaaagtttcagacttcgggggactttcagtgtttctgataccattgttgttgtcaagctctttgggcaattcgctgtccttatcgtagatggatttttaatggctgtgggaaaaggggaacgtgatttatgaaacgcttttacggctgccacaaattaatatccatatcgaactgattttgttaacagttcaatgggtgcgcttattgttaactcgagtttttcaataaaaatgcaacacaattactatatgttaagtgttttataatacaaaattaatacacacttaaaatgtataatcaatattttgcacaatttcctccagtttatacataacattcaaactactccaaaataattgctgttaattgaatgtgacacctataaagccaaaatcaatttgaaaccgcgcgttctgcaattgcccaacccaaaaacaatcttccactataagttagcaaacaaaaactgtacgctgaaaattgcgcggagcggggtaaatagaatataaattgtataaataaactgaacaaaaaggcagcgcaacactactgaggcaaaaaatgcaaaaccaattgatctaataagccaagaacgcggcgctcactttatgcgttcttcttcttttttctctttttttttgggttttatttaacaaaagcaagagcaacaataacaatagcacattttgcgggcgggcttccctcgcttaagaaaaatacgcagcaaagtacaacagaaaccagaagaaatggaaaattgtgtgcagtcgactagcgaatacccagtgttaattccgtactactggaacaacagacaaatgtaaatgtatgttctattttcttttatcttgttattatcagtaattgcaagtaattatggtcttattttaacatagcattgattcaatatcgtatttttaagggtttatcctattatagatcaaattaaaatattataccccgctattccatggtattgcacggtgaagcagcaggagagttgaggaaagtgattttgctcatttcgtggaaagagagcgcaacagcgccatatgtctgctggggcacgaaaatcgagttggccggaaagagatggcaggccctcagaacaccacagacgcaacagtctcgctcactcacactcgcgcacacacacaggcacggtgacgccgacgacttggcgacgccagttcacttgttgttcttgttgtgttctgtttctcattttgttgttcttattcttgccgggtattgttaatcattcgcccaggggcggttcaggcgttgtggggtaagttaaccaaccgttgaatgatgcaacggaataatgtaagcggaaagccatatgctagccattgagcataaatacctaatggttataataaattgtgattttgggtgcagtgtgcgaattgatccacaaatatttgcccacactgcgacgtttgattgagagaaacagttgatcggttccattaacccttgaatgtgtatttaaccgcaaaaaagcacatcctttatatacatatgtttagatacgtaatataatagccatgtttataataagatcctaattttcttgttttccctaatgcttaagacgtgtaatcttcgactggttcagggttagggtacggataaaataataattagtatttccactcctggcaatgtcataaagattaaataaatggtaatagggaatgtcttaaatggtgttgataacatatcgtcttagcttcaataataaaactggaaaaacatctcatctgaatgtaaaaatatcatattttaataataaaactaaacttttaagcaatgcgtatatagatacgaaaattaaataaactaaatcatgataaccgcg
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