Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT25946 chr3L 5263595–5265752 (2157 bp) shep, CG4669 activityactivityactivityactivityactivityactivity
not active
VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
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15-16not active0

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0052423shepoverlapping BDGP FlyBase
FBgn0035598CG466933865bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0011986tRNA:S7:64D71589bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0016031lama73124bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0052420tRNA:CR3242085848bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

gtggtttcgctggtgggtggttatggtggtttccaggggttggtggttacccaactcagacttttgctattttccccaagataaggtcttccgttagtgtctctatttaagcggtagctgtataatttctagttgtgtaatttatgtcggtaaaatctcaacaatctatacattatacatggactaacttttaagaaaatatttaaatataatgtgattttttttttgtggtgtcataaaaagttaaacaaattcccttcagcaaaaaactcatttccctttcaaaacttcttcagcgtgaaccactcatgcgattcctggattaccccaaaacaaagccggctcaaaattcttttcaacttgaaaatataagcatttttttttttgctagtacaaattaattccactcctcagcggaggataataaatggtaatgagaaaccaactggtacgcgacacgcagccaggaacaggataatcatcgggcaagataagcaaattgacgacggccatggagcattgaagataccagcgcaagtccgcggccccacacaacgtaattatttcaatatttaatgactctaaaaaatcaaaaggagcctatgctaatgacacactcacaaaaaagttggagctaaatgttagcttagtttaaatgttatgaattcaagttattaatattaagccactcctaaacaacaaatttcttataaatactcaaactcaattccatcaagaggtatattcccaaattgtataatttaaattaaatttccagagtatggcatattaacagacacaggattttttctgaaggacctcggacccacgcaaaggacactcaccacgggcacaggtatcacgcagtagacgcagggatgcccaccaacagcagcggcggcggtggcggtcggcagtccgtaggcggcgcacagatggtgatccgtcttaaatatctttgttggcggcggctgggcaatcagcgacgaggaggtgctggagcacgtgtacagcgtcgtggtggtgctggtggtgttgctgctgctgttgcaggtgttgctgttgcagttactgctgctgctgctgccgctgctgctgttgccgcttttgctgctgctgtttatgttgctgctgtcgctgctgctgctgctgctgctgcttgttctgcttgtggttttgctagcctttgctgcgactgctgttcctgttgtcccggcaacacttgttgttgttgctgccgctgcggcttcctgtggtggtggtggtgttgttgttgttgttgctggtggcggcggcggcggtggtggtggtgtttgctgctgctggctcaaggagctggccttaggatatttagcggctggctgtgttgctcctgcggatgttgctcctttcgatgttgctgctactgttgctgctgctgctactgttgctgctcctgccgccgctgctgctgctgctgctacggatgttgttgttgtctggacaactgttgccaccaattggctgacagctgctgccttaaattcgccggacttttgctcctgctcctgctgtgggtcctgttggctgaaattggctagcttcgatgttgctgcgggcaatggcgaggtttttctcttgattgacgcaattttaatggctaatggtgagcaggtttgattgtaaattgatttcctgggcttgcgtcggttttttttttccgccttattatttgcgactatctgggcctttgttttgaagttttcctattgatttcttattatgaagaacattgactagtttgctatgcgattttatattggctaaacactgaacacttatttaagttgaaattttatttacttgatttgcagttacttaagcacacacatcgatagacacaattattttcgttttttttatttgttttattcaagctaagctttttcaactaatttttggttttcttttttttttttaatggcaatttgctaaatctttttcactcacaattaagctagggtttatgtgtttacttttaggctagagtcacaaatttaatttggttttttttatttcaactttattgtctctatttatcgcttagagtgtgttttatatatttcttattcaaaataatactgtagatctttgctttggtgttcacttcgaagattcc

PCR verification status

Line was not verified.

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