Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT28339 chr3L 9947248–9949401 (2153 bp) CG34356, CG6685 activityactivityactivityactivityactivityactivity
weak
lateral epidermis anlage subset VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10lateral epidermis anlage subset1
11-12not active0
13-14not active0
15-16not active0

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0085385CG34356overlapping BDGP FlyBase
FBgn0036062CG668512455bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0026404Nc14331bp upstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0036063CG667417003bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0259932CG4245518164bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

ttgggcacacacagaaaagtcagcacttctaggggaaaaatattatgcttttcgtttaggtactaaaaaaaagcataatttaaatgctttcatattttataattttagggtatatttctgactcttaaattctataaaaaaaattatttaatttaacattccgatcctagagcgccgccgtggtagccgtggccaatgtgtttgatagcatcgatgagctctccattcgccgcatggtgctgcccaaggtgaagcaggtgttcgagaagaacataaccgatccgaagattgtgcagaacgtgctgatgtgcatcgaacgggtcatggaccgcatggagcgggcacaggtgggtactctagaatcccatatatcatctcatatatcttcttctcatatctctgtggcaggtcatggatgaggttctgccgctgctggcgaacattcgcattcccgatcccgatattatcatgcgtactgtgcgtaagttgaacaacaatgccaccagaagctgcacacactttgggttttgttgttttgatttttttttattccagtatcgaaaactaattaaagtgcatgaaacacaattttctccttggcccacagcgaacaatatagatttacacgagtttatctgcatgctagcatggataaatacaaattgcccacagaggtttactttggatcgaattttccacaagctgacaatttgatttagttgtatggaaaaagggggagcctaattgttaacagatgcttggctttatttcataaactaccggatttaattacttactaatttagtgcgacaaataatttcattgcaatgactttgtgtgtgactttgggggaaaactgagattttccaattaattaagattgattaaaaatgacctagagctgcttcttaagtaataaattgagcttgagctttaaatactatttttgaattaaaaggcgatgtgagttaatagcttggcaatgttttcttaatatttataaaatcacttaaattttattgcagtattaagtatttcaatttataagatttaaatctaggtacttagctgcttttgggatatgtatattttatttttgagctgcataatcctggactataatccttaagctcttatatactatataatttgatgtactatcacaattgaaagccgtagtaatgccagtaatataatgccgagtaataagcttttggtaataaaatttctcaggcatctaccataaactgtttgtggacaaaacctacggactgaccgtggagacgatggccaccaatgtgctgcccctgctcattccgcacacggtgaatccttcacttaatttcgagcaatattgctacctgctggaggtaagtacaccaagggtagttatttcacctgaagatgtgaactaaccaactaatgatgttcttgggccaacaggtgctgcagcaaatgctagaggccatcgatcggcagcagaggaacaagttgaagctggacaacctgtcgatggcctcgccggaacgccaccgcaccctacgtcatcagttctccacggacaacatgaatgcgccacccttcaatattcccaacttgcgtattgatcaacgcaagacgtccagtgccgaggacatggcccgcaaaaattctggcggtgagtgaatccttcgagtcctaaatataaacatgtatatttagtcctggtgaatttggggaggaaagtgtcagctttctaattaaagagttcactgagaattttaaaacaaaccatctagaaaatgcagacaaaaagttgaatagttcaagctttcattttaatatttccttttctgtgctaaaacagaattactttgaaataatatttctagttcatctataatagattagtcacatttacaatcgtacgcaaataattaatgcacaaactagtgaaaagtaaacggaatgaaggtactttaggaactttgggtatccttaaatatgtatagatttggccaagtttgtaaggacgggactccttgcccatttggttcgtcggttgagtggccgcctgtgggcatgtgtaattggaaatttcgacgtgatttcagtttgatattcatcgaacgtgacaggagtcgtttgtcctgcccacttactaatcagctgcga

PCR verification status

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