| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT29778 | chr3L 12641178–12643551 (2373 bp) | CG32111, CR43431 |
active |
dorsal ectoderm AISN subset, amnioserosa AISN, dorsal ectoderm anlage broad | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | dorsal ectoderm AISN subset | 3 |
| 4-6 | amnioserosa AISN | 3 |
| 7-8 | dorsal ectoderm anlage broad | 3 |
| 7-8 | amnioserosa anlage | 3 |
| 9-10 | dorsal epidermis anlage broad | 3 |
| 11-12 | dorsal epidermis primordium broad | 3 |
| 13-14 | not active | 0 |
| 15-16 | ventral nerve cord subset | 1 |
| 15-16 | brain subset | 1 |
Whole-slide images
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0052111 | CG32111 | overlapping | BDGP FlyBase |
| FBgn0263379 | CR43431 | 829bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0265746 | CR44553 | 10825bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0265745 | CR44552 | 13748bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0015919 | caup | 26281bp downstream | BDGP FlyBase iFly |
Sequence
tttgtagggccagctttcttattggattacatttacctttcaatctgtttatatttatattttatagcaaaagaactaagatttaaagcttgtccttacacttatacttacttgttacttacacttacacataatcatacttcataaatattccattccacattaattatcagaagacataaaataaattatttaaaagctcttaatattattaggtacatttataaaaattttacttttaaggtccaagtttttgaaggatattatttttccgattctgatcaataagttatcaaattactatagtttttaaagtagttctattcctagatttaatgtgggcaaatatgcttctatttgacttaagtggcatcccctaaagtgatatttaatacttctacttttaatactttctgtgcaacaaaaacagggcaacaaccaggattgtaatataaacaaacgtgacacacacacacttccttaaatagctatataaatgcctatccacccagctaaagattaacagtcgacgtttgtagtgccacgccccccaaatgagaacagtagcgtagttaatatgtaatccccgacacgtggagtaaattatgttccttgaagggctgccattaggacgagtgcgtcttggacacttcccacaatcgatgatggtgcagcataaaataaaatttggggtggaaaagttaacgccgtgttataaggcaccagattaacctatttaagtgatagcatagctatataaaatccctttgcttacgaagcatgcatacttttgggatactgattacataaacgcggactacagttaattatttcaaagattaacgaattttaaaactgatctagcaatattacaaatgccattaggctcctgtaatctcattcccacgtcgtaagatctcggtagcagtcattcccgctctccataacataatacccataaacatatttttatgtaacctacatttaaaaagggcatgacgaaatcttaacgtaagactagtcctttccgtgaagattcattgtgaaactggcgccattcaatgtgatcgctcctaccaccgccgtccttttgcccctgataattgtttcttatcggcgagacagttgtgaatgacaattttttttggacaataactcggttgtgggtcgtcaacgcggcaccgtcgccagcgggggctatatatggttataattgccaggcaggaccggattacacgacaggtcgatctgtctgcagtccatgccatctttcccatcctcctctcttctctccacccatccgaagtgtatatctgttacacagagtaatgatcgtaatgtcgcacaagtatctttaagatgcattcgatatttcagaatgaactacctgcctgaatgtcgtccgtttgttcgtatgtatgtccacttgtccgtatgtccctcgtccatcccgaagtcaacagcaaaaaggctagttaatctgtgccgacctcgataacgttttagtgctcaattttgattctacgccctttgtggtttgggtctttacaactgtttatgccttttatgattttgtcgtggccgtttctcgtatctgcagcaggccttttggcttttggattttggattttcggtttgggttttgggcttggtcaacgtcgtcggctggttccaaaggggcaagccggaatgggtccttacctctgtccttagctgttatggtctgtaatttaatatcctagctggcattggacttttgtttaatcatgacagccgaccgtcttactcggcgacacacagtggttatcgacgaatgctattggcgttacgccgctcgatgtttcacacttttgcccttgggccttgtttaggcccactgttttttgggcttgtttggccaggttcgtgtgcgcggccattaaggttttcggtctggccctctgatttcctaaatgtccgcttcgatccaagcagatcccatcgaatgcagggccaaagccgagaaccttaccatttcggcgctcatttaaatattttatcatcgccgcactggcaagacactaaagagaactttatatcttttcggttcgctacgtttttatcactcgaatgaacaaaaacatttgttaccaatcagagttcttaattttatggcctgtgtttgcgacaaaagtgccgcttcttcttgtgtgccccaagactctccatctccaactcgaattcgatcgtttgtcggctttgtcgcagaaattagccgcgtattcctttagagcttgtatgtatgtccaccagtatcttaattggctttgatgctgcgatggcttttcataaacgtcaggccggacatcgcccattccacactccctattcccaa
PCR verification status
Line verified as correct.