| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT33043 | chr3L 18920938–18923123 (2185 bp) | CG32204, CG43049 |
      active |
anterior ventral nerve cord broad, ventral ectoderm anlage, brain broad | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | not active | 0 |
| 7-8 | not active | 0 |
| 9-10 | ventral ectoderm anlage | 2 |
| 11-12 | anterior ventral nerve cord broad | 3 |
| 13-14 | brain broad | 1 |
| 13-14 | ventral nerve cord broad | 1 |
| 13-14 | anterior ventral nerve cord broad | 4 |
| 15-16 | brain broad | 1 |
| 15-16 | ventral nerve cord broad | 1 |
| 15-16 | anterior ventral nerve cord broad | 4 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0052204 | CG32204 | overlapping | BDGP FlyBase |
| FBgn0262351 | CG43049 | 1731bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0036833 | CG3819 | 5731bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0036832 | CG18223 | 7520bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0036831 | CG6839 | 8580bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
gcatagaggaagccgccaactttttacatatgtaacggattcggtttgatttgttgtcctcgacggctttttgtaatttatttgcttgccttagctgacttgaagcccattgatttatgccgtgcgccgagcggcggcgcaattgatagtctgcttatgcaacaaggacctcccgatgggcccgaatcctttgtgtgagatgttttccattaaacaaatggtctccccagcactgcgctatgaaaacgtcttcgatatgcattaaaaacatttcaccctggctatccggggatacgatggaggagcactcaccttatttacatggtcgcgcaggacattggagtagaccatggcgacagcttccagggccataaatgttatatagccaattatccagggtacaattagtcctgggttctcctgtggaaggacgaaaaaagcggaaagcaccttaaatatattgccattagaaaataaagctaaaagggccaccgaaaccagtacctgtatggaattggaggtattgatttcatggccgtactctaaaatttgccaggatgtgggtgttaaaaaagcgtgagtgcggtgcaatttatctcgccacggtggcgaaacccctgattggattttttggggttttttcaatgtgctaaaatttttactgagcacgttgggaatttctgatgtgcagctgacagtttttggccgcagcggtttgcatggtaattttgtgggggcatgaaaatgtattttaccagcggattacattttaatatgggctataatgcttgcctaatttttgaaaatgcaattaatcccataacgaacattctatttaagcaactgtagtaaagggaatttgtgaaatgagtataactatggttacaagctagttttatttaattattactttagttgattgagctgctcatttagtacttattttgtataatttaatattcgtttgaaaatacatgttcgttttgagatattaaagtataattttaaataaatgttaatgttttaatactcattacataatgtatagttgattgcactgaatttgcatttaatgtttaaataataaaagagataattgattccgtttttcaacttaaaattaaacaaaatccagtgttttaaacaatatttcctaggcattaagtttccttcattttcagtttcaccgtattatccaatttatttgcagagttcgaatgctgaaattaatgcgtgtgttttgaagtcaagccgcaagagtccttagagtccaataatgaattgtttggctattatattggctatcaaccgcaatgttgtccaaaacttttgctctttcccccaacatttgttgtccgaacgctcgtttagcctaattaagaaccaatgctctatgcattatttaatggccatctgctgcgggcttttggcctaagtgtctaagaatagggcgccaattagcgagctgcaattaatttaaccatttagcggacttggttacattttcattagcactgggcagcgccaacgatggcattcattttcgtcgaattcacgttccaattttgtctgtcagcgtcaaaatgaaaaaattccacaaaatgtacccgaactgaactcggtctatgcaatccttctcaagggtcctggcagctcgtttcgcgacgagtcagtcagacttaatcccattcctgtgccaattgtgtgacaaattgtccacattttcatgccgctgtcgatggaatgctggctttttcacatttaggggagttccttttcataccacaaattttacaaaaaaagttcaacattttactatggcaatatattagtaagtgtaaagctatacattccagaaaaattgtgttctttatttaatttgaactcgattacattttatgactaacacgattacaagattaatgtctgtttttaattgtagcactaaaacctaattttttgagtgtaccccatgcacagcatttggcgcccaacaaaatcatattagaattttggaagcaacgcggtatgaccgctttcagtaatttacatttgaatgcgctttgtttgctgggtaaatactttctgactcaaaggctctgggaggcacaatgcgccaaatttgcggatatttgattttgagtatttcgatctatgggcgggattggggtggaccattattgcct
PCR verification status
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