| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT33919 | chr3L 20660027–20662136 (2109 bp) | CR44685, kni |
      active |
posterior hindgut, anterior endoderm anlage, hindgut anlage | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | anterior endoderm AISN | 1 |
| 7-8 | anterior endoderm anlage | 3 |
| 9-10 | hindgut anlage | 3 |
| 9-10 | esophagus anlage | 3 |
| 11-12 | hindgut proper primordium | 3 |
| 11-12 | esophagus primordium | 3 |
| 13-14 | posterior hindgut | 4 |
| 13-14 | esophagus | 3 |
| 15-16 | posterior hindgut | 4 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0265896 | CR44685 | 12802bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0001320 | kni | 25403bp upstream | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0037014 | CG13251 | 26018bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0265893 | CR44682 | 32277bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0265892 | CR44681 | 33444bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
cggaagtcgtcgcaatatgagcgtaataactcaatcattaccatataataaccagctgtgactttgggggcgtaactgacaaagttcgatctgaatgagtgtacatccctgcaaattgcagtggaatgcttagcggacctcgggatgtaattgaagataaagcttagtcaatctgttatcgcacctagcattcaaaatgtaaaacttatatataaaggtaattagaatatatagaaatcttcctaaactgcatctccaattgaaggaagtgggctctgcactcgtatttgtccggccaaaaccgaatgactaacacttttgatgatcgctgggtgtgcgggattaggggcgacggtgtccgtatttgctcaccattagtatttgttattattgttattactatgtatttgaattgctcaagaagcttggctgccagaggcggcagctgcttaaaaattagccaaactctaactgccagacaaatgcactttgttctaggcctcctcggactgcagaccctcctcacacagccacagccaagatccgggcaagttgaagttgaaaggaaagccgacgacttgtggccaggtctcttcagctgggtgtttgtgccgaagcgggaaaactgaaaatctaaaaagtggagtcgggaacgcgtcattgttgtttacacaattattaggacaacaagccgccgatcgagcactggactttgctggtgtttgccgtagccactggctggttaaatagctcagagccgactttgattttccatcgtctggcgttggtgatcgctgcctcaaagggtgttctatgggtatattgggattaagcggattaagcacatcttcagtgtctattcgtgttcagagggatgatatactttttaactagcagatattattgagatcccaacaagagcattcagagtgcgaattgacagattgtcaaaatttaatatttagtagttggagttcatgttgcttggattatttttgtattaaatctataacattttagtaattattttataggtagcaatagtaaccttaccaacccgtgtcaacttcccttaccatcaatgggcatctttagtgtccatcacccagctaatccccatctgttaaacttcctttttgttcctcctgttttctttggagtgctcaatgaagtttgttctttggtggctgtcaattacggcgagtgttgttattgttctgtcacgtaatgagcaggcaatttagcacctgcccgataagcaaggcacgtctattgatcgataaccgaaacaaggaaaccgtagtcctgccgaaaaaaagcgattccggctctgtttatccacggcgtgatggaagaacaacaacggtagccggtcgaaggatgctcgtaaaattgatttatttgcgcaaatgcaggttcgactcataaatgttgacatggcccaatgccagcgtcacgatcagtcagcagccagttggctaattgtgtatgctaatggaatgcaattgtgtcaaagtcctgcagtacctggaacaaccgcacaacatcatactctgcccgtgatcgagggatcgtacactgataaaataattatgctaaaaaggctctcgtatatttgtttatttgtaaaatattcttggtgccccttgtgagccttcataattcttcaagaaaaacattaaattgttcatacgctttagattcgtttcgaataataatttaatttaataaaattttgtttgaaatattaaatgtgaggaaatattattaccacattatattagcaaacctttgagaaagtgtctttacggagtagaaatatttttgaacgtgtgtaggcataggggcacacacacattacgtggagttcagagtacttcgaggcacacaaataaatttataaattattaaacattggcgaggagcagcgctggggcttcggctgaagctggagccgcagctccactgcctgccaagtcagaggtgcggagacccggagaccgcaacgggcaactggaacatgaccgatattgtgcggctaacagttatacgatcggtccaagtccacttggtggtcgtccggggtgactcggggatcggggtacactaa
PCR verification status
Line was not verified.