Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT35190 chr3L 23240019–23242320 (2301 bp) nAChRalpha4, CG34031 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
ventral epidermis subset, head epidermis ventral subset VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14ventral epidermis subset2
15-16head epidermis ventral subset2

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0266347nAChRalpha4overlapping BDGP FlyBase
FBgn0054031CG3403161229bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0264698CR4396763007bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0010215alpha-Cat71727bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0263573mir-494292309bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

tgtcattattccttaaatactgtgcccaaaaatttattggcttgtcaaatatggtaataggagttatgttaaaatgtatatttttcagtgctgatggtcattatgaagtgacacttatgacaaaagcaatagtctataataatggattggtcatatggcaacctcctgccgtctataaatcctcttgttcaatcgatgttgaatattttccgtatgacgtacaaacctgcatcttaaaattaggaagttggacctatgatggttttaaggtgctactcaaactgtatttcactttaagacgtttggacctatattgttttacattttttagtcgacttagaaaatagatcgcatgctgaaaaaaaaagtaattgttttatgcttgcgtatttcggtccaatttattgatgttcctaaaaagtttacattcaattaattgcctgaccatttttgtattgttcgacaaaaataccaatgataataatctttttttaggaaaatattttttatcgaattaaaatattctattttaaatagagcatgatttttataccgttaaaataacactagtatcttacataaagagaacatgatatgggcacgaatattgttgaatattgtttatatatttaaattttgtttttcattttctttgcttaatacctgttaaaacgacagctatcgaaaattgcatctttagtgagtacaagaatggtgaatggtgaacatgaatttttccatacagacaaattaatatacgaatgttttttttatgaattccagcgatttatttgtacagtcgcatgaaaacttttgatattttaatgctatgaatacactaaacaattttaataacatttgtaattttgtatgaattaaaacggaaactaacactgaattcgcttattaagcatctagttattttctacagacaagaaaaacgatttaagcatgtgaattttattccaattatttacgatgaaaaagttaccaaaaatatatgtatatataccaataaatatttgcgaaaaaatgtcttgcctatatttttgaaatgttctaattattttgttatatccgtaactcgttaagtaaagggaaaaattacattcgtggaaaggaagcctgagattcagcataaagattatagagatatagacgcagcgcaagcttgttttttcatgctgccacgcccactctaacactcacaagccggtcaaaactttcacacccacatttctgcaaaatgttttgtttttttttttatatttttattagtcttgtaaattgccatcgatctgccaaaaaactcttgccacgcccacaaagcgcccaattattctcattatattcttacttgcactagctaagttacgggtatctaaaagtcgggttccccgactatagcattctctcgtgtcttgtctttcgaaatgtaaactaaaaacatttaaaatcataagcacgataatataattaaaatatattagctatgaatgttgcttgttacctgtcgcttacattatatgctacgattaaattattagatttgttaaagtacagatattagataaataaatcagccgtcaactttaggtagtttgttatgatgtataatgaatatgttatttatctaaaaacattctgttaagttcaatttaataagtcatataattgtgcttgttaacatcacaaaataataatccccatatcgtagaacttgtgaatcgttgcttatatgcgagagcgcgaaacacgaccgcggatgttaaatccattaattttgttttcccaaaaaacgacgaactgaatacattttaaaggacctcgttgaagattccatgtataactgaggagtggattcctgaaatataatttcgggagtcggtacctcattcgaatcgtattagggtagggtacaggttaaatattatattttttcaactacttaaataaggaattcaccgtgcactactttacaagcaaacgcattcgaataacaagatgcataacggccatacattgcttttgtactatgcagctacttttgaacatacattttaagaaatatatttcattaaaaatactacgaacatacatagttaaaaaaccctactctactgaatactctaatgacaattaatccaatacaaagttatttataaaatacatcatgtgatattatgtacatagattcggcttataatgtatgctatattaaaatacataattatcacattaaggcaatgcaaaacaagaattttgtacatcctaatcggtaattcggaaggtgtcgcggtaa

PCR verification status

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