| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT35219 | chr3L 23319509–23321881 (2372 bp) | alpha-Cat, mir-4942 |
      active |
posterior endoderm AISN, posterior endoderm anlage, posterior hindgut | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | posterior endoderm AISN | 2 |
| 7-8 | posterior endoderm anlage | 2 |
| 9-10 | not active | 0 |
| 11-12 | not active | 0 |
| 13-14 | posterior hindgut | 2 |
| 15-16 | head subset | 2 |
| 15-16 | telson subset | 2 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0010215 | alpha-Cat | overlapping | BDGP FlyBase |
| FBgn0263573 | mir-4942 | 12819bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0052230 | CG32230 | 12917bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0266347 | nAChRalpha4 | 39281bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0054031 | CG34031 | 140719bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
gcgcggcaaagtttttcttttccaactcaagaatatatatactttatatggtcggaaacgcttccttctgcctgttacatacttctcaacaaatctatgtatacccttttactctacgagtaacggatataattatttaatctccgaaagtattacgatataataatattaataaactaaatttctctccgtttttggagttataattataaggtcagaaaaagtggttaaatttcacaccttcatccaattttttcggaatatgcagattctactcacatcgacttcgagtttccaaggttaagtcttcaactggctcaaattcagtatctgtatcaaggtcttccgagctctgaaaataaaaagatattattagcaatttggatgttgtttttaggaaccaatgcctaattatatagtaagtcaataatttgtactctattctattatcatctgtgcgtttaaaatggttgaggtgttgaattttgagataactggttattttgagatcctattatgtacagttgtaactcgttggtgcttttcttcttctcttcgaatctgtcgttcttgtttagaaaccttattctaagttgcctttatttagccgtcgctttcatatatgtgactgtgtataccgtaatgcatgataagaccaaagagagtaatagttatcagtgtttcttagtaactagggagtgtaaaaacagatggacaatttgcattaagaattgttttgaaagtatcgcaactaaactagtccagtgataagaagtaacgtttcggagttagtcgttattttataggtaaaagaaaccggttcagactctataacatgcatatattcttcattaggattattagccgttttcgtttgttcccataaccgaattctcttaggatattgacaccggctctataaaaaaaatatattattaaagagtcaatatacattttcaatcacatgcagtaaaatgcagtaatgcttcgaatattcttttataatatttatgtgagtgttgcttttgtctaacggtagaagccaaatcataaatctaagaatatgggcatcttatactacttactcgattcattaaaacagctcttcgaatttcacgaactccgtcgtaaaccaaacgagaagcatcaatgaagtcattttcgtcaacatccttattggagttatttgaaagggctccaacggctgctcctacacgttggtcaaatttcatcataactaaaaacaaaagattaatttaacggcttcgcgtaccaagattttacgtatataaaaagccggtgtgaaattggtatgcacacccggcagtgataaagattaaaaaggactatgcatgataataatagttatttatcttatattaaattatattatcagacatgctccggtagtcaaattcgtaagaaccttaggattttggtgctcctgttttcgaaatcgtaaaatttgtttcatttttaaactgaagagtaaagccttttttttatcaaatcagattttatttatttatttaggaaaaaagcatactcagtggtctattgaagtttattccacatcaccacaagatcattctgccacttagttatatacttataaaatttaaaatagtcaacttaattagttacttaaatggtcaaataaaattaaaactcagaaaaaggtggcagctttattgcctgtttactgtttacaaaacattccgatagcaaaaattttgcaaaaaccagagcacctaaaaacgaaatcgaaagattttgtccaaatcgcaataaaattacgattaccggagcatgcctatatattttattctatattcattcttaataaatggcaaagaccatagtattattgatagttgtattaagtattagtattaatatgtttaatttgtctgtagatataataatataacacaaattagtcggcactaaaatttagacagcacaacaattcaatttttttttatagcttactaaaatattggcataaaagaaaagaacattttcatttcgctttattcgaagtttattttttataatctttttttataaccaaataatgaaaattttgtttcccaaaaacaaaagtttatttaatattcaattaagaaatttgagaactctgtataggaacatggtattcttgtctatatgtacttatggccaaaacgattcaagtaccacttaaatattttttactatattacgtaacgaaaaaatgagaatttaataggaacaaatatttataagtaacgtatatttagttacattgaaaattaacacataccttgatctcgtagaactttgactgcttctaagactcgtttggtgtaaatacatggttcataattatcc
PCR verification status
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