| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT39496 | chr3R 6333339–6335849 (2510 bp) | hth, mir-4944 |
      not active |
VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | not active | 0 |
| 7-8 | not active | 0 |
| 9-10 | not active | 0 |
| 11-12 | not active | 0 |
| 13-14 | not active | 0 |
| 15-16 | not active | 0 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0001235 | hth | overlapping | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0263547 | mir-4944 | 5388bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0266260 | CR44955 | 42640bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0266244 | CR44939 | 45540bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0037817 | Cyp12e1 | 70914bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
ttccccatattctgtttcggccttgttgttcctacgccatttacctggcgatttgtggcgccaacaggttcaggaattcgttaattggtttttagttctttacatagaagcttcaattagttaattaatttaatgatactgtttcctttcaatatatttatatttaattcattctggcttttaagtctagcaatttagttaaagttaatttttacacgcacaaacatttatttaattcaattctccatataaatatatttatagtttttacttcttagagttttcttttgttttattgatttaatttctggatttcgcactactaagttagctctccctttctaactctagtgctctgtgtcgctcgctcgctcgctcgccaactctctctttctcgcaagtgtgttgattttatctatttctagctctttcattcttttggatttacgtgatgttgtcgcgtgggtaagttgtataaattgttcttccattttaacaagtcctttgttaatttttttctggtgcattttagtctatgctcagggttgcatttctgctccctatccgtctcttaccatttatcgctaggatctagctttagattagatttaaacttaactctacaattagtgtaatgtacttaagtgtgggtgatgtatgcaaatgttgcgatatatttacagtgtagtctacggggaagttatcaaaaatgtacaatatttattacatacattacacttgaatatgtaaatttataatcgatttatcaatcgtaataatcataatggtaataataatgttgctgcagcactttataatcatattcataatatttacggcgtatacattaaagtttcgagaaaaatcacattttaatttaaattctgacacgaaaatgatttcaaacaaaaaagccttcgagttcgtcttttccatatacaatgcgtattatttatcgtatagctcattatctggattattgtgggtgcttatccacatcgatccgatacgcacaaatattgccatataccctcataatcaatcgcactgatttaatttacaagcttttgtcggttcggcgcagcgagcatatcccccagatacaatagtctggatcagatactgaacatccccacgatcgaaagttgagggggcatataaaagaagctcatacaaaatactaagaaactctcgggaattctcggatccaacaaatgtgggatatcactcactgccttccgactcgactgcatttggttcccgtttcttaagccataagttgtgtatgatatatagtaatatatatactattcgagattcattaaaatttagttaggtataactaggtatagtttatgttctgtatatagactcgtatacatcattcattcattcaatgcttccactttggtttctcatttaaggcgttctgtacaatttgcgtttaaacgtttctcaagtcaattgttgggtcgattatttaactactttatatatatatagtctaataaattactagcgatgcgtactcgtactcgtatatcgtatagatttgatgtataattgtgaaaatgttcgatttaccttcaattcaattacaatttctattcgcaaatacagcatttgcaattaggcaaaattttgtaaataaatttatcgcttcgcttgttaggtgcaaaaaattcgcataaggttttcatccttggggattcttagagaagttcgtatacatttgagtgattgtttcgagtgtagtcggtaagaagtaagatgagtttgcctaagtgtgtctgccaatataatgttgggttcccatgcaaaagaagctcaagtttcaagtttcaaagagcaggctaagtaatccatcttatttcgcgtttgtattttcaaaataggtactcgctttccacaccttcaatctattcatagttaataagtttcaaactaaatacttaaatttcgatttcctgccctctgcatttacgtatatcgtttccatttaagattaatcagattcacaagcaatgtaaattcaattcagttccttagcatgtgacgtgtctgccaaaagatccaacacgaattaaaataaagatatcctgggtggagaggatataaggctcttggagtctatatcccccaaaaataatagggtttgcccgcgctgaaaagaaatcataaccaatcagaaccaaaattgaaataaaaacactaagaaagattattttttcaaatattttctcatatatgcattttgttttcatcaataaatcatctctcgtacaattctatcctcttgaattagttaaatttaaatcattaattaagtaaatgtaataataataataatagttaactaaggattaacgcatacaaattagaatacataaataaaagtacagtttaaacgtaagcataatttattattaatattacgtatacatattcagagttatgtatatgcctatgccattatttgtatcgtattgtttgtatctcgcataaaatcca
PCR verification status
Line verified as correct.