Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT39527 chr3R 6390230–6392351 (2121 bp) hth, mir-4944 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
brain anlage subset, brain primordium subset, brain broad VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10brain anlage subset3
11-12brain primordium subset3
13-14brain broad3
15-16brain broad3

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0001235hthoverlapping BDGP FlyBase iFly
FBgn0263547mir-494451376bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0264788CR4401874771bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0266260CR4495599531bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0266244CR44939102431bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

cgatttgacacgaaccttcttcgattgttcacagtgcaccacacaaattgctgaagtatagaataactttgctcaattgttttgggcttcgctcacttcattacgctggcgagaagtttgacttgcggtcagtctgagaactttccaagtgacttggctaagtcggctcagctgcggcagataattgctgtcggaatgggaaatgggggaatgggcaggcgtcgaacaaatatcgacgcgtgtcgagctgcgttccacccaaaagtcaaaacatgcaatttccatagagccctgtaatttggtaaaaatctctgtcacagctcctggccggttggttaatcactacaatcaacagtttcgggacgctgccctctcgaattcgagtcccatcgaaaactgaagcaaaacaatcaaattacggttcgtaactcagttttcggtgcgtgggaagttttccctttcgcagtgggcgtggcacacgcagagattttcctcccttcttcatcactggccgtaattgcccgacggcgtatatactgcaattgacatacgggagtgggttctcgggggtaagtctaagcctaacccgcggctgaaatcccaatcccagtctgagtttgggtctgggattaggccattgcctcgggctcatttcacaatttaaaatacaaactgcagctaagctgggaagggaagaggtatgagtttaaaaaaaaaactgcaataatcatacacagagaacgaactccgatttaaagatgataattatttttgcactgcacaattttgattgcttttggtaataattttcctctgtgcagatagtcctgtaattgtgtttgattttgtttcccgaacacccagccaagtggacgtgaaacatattttttctatttgttggcaaacacgcaggaaaaaattttctcccccatcggatgagcatatccttagagcaaataattaaatcctttttacacggccgctgcgaatgaaagtttttccgtgcggtttctggtttcgcaggattttcggggagatgggaagtgctcgatgtggaaaagtgagtggcagcgagtggaagttgagcccaaaccccaagcccagtcgcagtcccaatcctcggaacaatccctcctggctgtttgttttgatggatttgccgttgttgttctggggcaacaaaagcttttgtttgtctgtttgtgtcatgtttgttgttttggtttaggttttggttttagccacaaggccctccagcccggaattctctcggtctgaagagtctttggcgttgggtttctgttagcaggctgcttaattaacggtatataaccaccccaaccctttgcctaagtgtgtgtgagcgagtgtgtgccacttgagcagcagctgctccacccttttccacttttccccccgttatcaccgccccttttcgccggtttttccctgttttcaggccacccacccactactccccttttgcgctgttgccaccttttgtgtatttaattgcgcgcatggcatttaattgtttttcaaatttgctcaagctgtaaaatgtgtgttcatgtgtgtgagccattttgtttggggggttgaatttttaattaaagccagtggaggtgcaaaactccttggaacagcccgaacaattcaatatggctgactgaaatcgttcgccccctttggcagccatcacttttggcaggcaaattgctttactaagaattttccacaaatgaatgaatggatgtgcgagtgtgagtgtgtgtgcggggtataatttcaatcaaatggcaagttaattacacacaattattgtgtacactcagacagacaaaaggcttaaagtttgttcaagtttgctttaagtttattgaaattaaaggcgctaagctctcgggaaaagtgttcacctcaccatcacatttatttatttctttattcacacaataattccatattaatcagcgtctaagtcatcggctatcagtattttaattaaacaccaataattacgcacatttcaggccgactgctatcatatcttcagaattcgaacatacatccacaggcaatgacaaattaattttccagttaaattccagctcgagtggca

PCR verification status

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