Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT42789 chr3R 12631308–12633494 (2186 bp) abd-A, Glut3 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
ventral nerve cord subset VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14ventral nerve cord subset2
15-16ventral nerve cord subset3

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0000014abd-A1628bp upstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0015230Glut315566bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0266250CR4494520915bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0264857iab-825530bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0020556bxd32398bp downstream BDGP FlyBase iFly

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

ccgcagcatccacaattcgagtcgcggggctgggacggaatttaaagtaggatcagggcgtttgcggctttgtttgccctgtcaaaatattgtaattctttttcggccgggctcagttcgctaacgaatttgaatgccataaactggcagagtttatgtgcgatttggcattagaattacacggccgactaaagccatccgcggttttggcgattcgcgtagcggcggaaatacagttgtacaatatgaataaaacatgttgagtttagatcatggattggtggttgcagccatctgtgtgattacaaaacttaaataagcaaaagtatatcaattgagtgataatgtataaccagctaaattttgattgatccaaccaggttgtgttattcctttgctctatgtattaattatataatatttattaatcaggggacagtttgctttaaatggttttggcagagtacatgacataaaatatatatatcacgcgctgccttatcgcgtcgatgatcgccttttggggcagtttgagcgacgcaggaaacttttccaataacagcatccaaatgtgaacttatgcccggcccgtctacgtgctcggaatggcgagcggcgacatccgccgtgaacccaataagaacccagccagctcccatttccacccacatgccccatcaatggggcaatctttggaacgccattctgacgttttcgaaagtttcttttattgcatacatgagccatttggttgccggggcttccgtttccgccgccgaggactcagctcgttgacgctgccattacgctgtcgcagctccaaaaacaggatgggtgtatcgtctggccacaactttcttcgacgggctaggatttgtacccagtcccgtctatccccctcgttcggttggtcgtccttcgtcctggacgcacatgtgggcgtgccgaaaatggcgtcgttatgtgtgcgcttattatcataatcttttgagttgttggcgcattaattaaatttaattaaaggcgttctgcaacatatccgcatacgtggctatgctgccaattgcaatgccacatttcgaatctccctttttcgaactctaaccccaatctcttctgcgacgaggcatgaaatcaatttgcgcaaaatagcattcgttaattaatatttttgccagcgacattagcaaatgggaatttatgccttgaatgtgaatatattaatctattgaatggatttaatactaaacacatgctccgatgtatgccacgattctttgaaagtattcattacatatatcaagctctattgggatacaaatgtatgcttggtataagtagagtatatgcattaaataatttatgtagtgattgggcttaagacgcgttattattaacactcaagacccctttttgtaaaaggcatatgtttttcattgaatttaaattctttatctactttattcccaagacaagatccacgaacagggcacccagtcctcaatcagattcacacaatgcattggttttatttatttattagttcttcactgcagtttttcgcttatgcttacgttatttttaatttccctttttttcgggcttgctcatagtttcatatttattaatccccttggctgaaatctgtttgcatgaaaacgaagtatgctttctaggttttatgcatttgcttaacataaataggtgtcatgcagttttatgtacaaatacgatggcaaatattttggagcccgtcgatcggtttcggtcggtctaatattaggattttttaggttcgaatataattcagttacgtatatgcgggttcttgaactatcgcaatctccgaatattttcggctgagtgagtaaacttggttggttagtaaatagtatcgccttgattctacgtatatatgttctttagacattagctaatattaaatttgatttgaagtttttggacctcatcgaaaaggtcagcgtatggatgggttctcgttgcagttgcttcccaggcggagtaaaacaacggtgtttttaatttttttcgcattcattttaaaatcgcataaaattatataatacacaattcgtcacaactaaacttaaagtaaaattaacagaagttttagcagtagggttcaaacaaaatattgatttacgatctaatttgctaggccgtcca

PCR verification status

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