| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT44648 | chr3R 16173693–16175852 (2159 bp) | Ir92a, CR45023 |
      active |
dorsal ectoderm anlage broad, ventral nerve cord anlage subset, anterior ventral nerve cord primordium subset | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | not active | 0 |
| 7-8 | dorsal ectoderm anlage broad | 2 |
| 9-10 | ventral nerve cord anlage subset | 1 |
| 11-12 | anterior ventral nerve cord primordium subset | 1 |
| 13-14 | anterior ventral nerve cord subset | 1 |
| 15-16 | head subset | 1 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0038789 | Ir92a | 4070bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0266381 | CR45023 | 10868bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0038790 | MtnC | 12337bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0038788 | Sirt2 | 17057bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0038787 | CG4360 | 19969bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
agcggaggctttgaacaggatggtatatagatataacggttacgcaaagtaacaaccaaaactatggtaatatacaattcaaaatgataattaatctttaaacttttattattatgaaaaaggacttacttgaacagattttatctactgtaaacatggcgagttttcttttggtttgaaattattgttacattgtttttgatatctctgtgattttggaggaatctaacaattaaaattagttaatggcgaaaaatccccattagataatcctcggcagccgccgtcactgtccaagtctaattgaggagttaccgtttgactggcaggttctttcactctctctctctctgggcttataacggtaatctgctcgcagttttgtgcccccttccaattggaatgtcgagtgacaacagcaaagtcaaagccgtcagagcaacaacaaccataccaacaagagcaccgttggaataacagaaatgtaagtgggctcaatccattgactatcctatcggaatctgcctgaaacaagacaaattgcactccggccaggatctatggctaccaaatgaaacagagccgccgctcaaagccggcccgttttttattctcgttttcgcaaagagttcgagctaggaataaggacaaaggataagaaggacggcagtcggagtcctggcgaagagtgagtcaaagagagttgccagttaccaatttccaggtctgggccataaaggcaagccgtgtcgaaatgctgctgacgtttcacattcaaatactcgagaaataaaaaaaaaacctgcaatcgctttacaacgaggattgattaccctaaaaatggagttttgaattatatagacgttattattgtatgagtggtatgtttttagttttatattatttttttattaatttgaaaaaaaaattggaacttgtttttataggtgcttatttttcaaattcatgttatcaaacgtatttgtgtatatgccagtaaaatcagcttgaagggttttattattcatctccctttaatcggaaataatatgcttaattactcacggtttttgtggtgaaatgaatcaaagctaattgttaaaaatgacatctaagcgagagctaagcactttaagtgttaataagccctttaagaaattatcctcgctggtgtcattattctccttggtgattcggtgtctgtagtttgtaattttcttgagttaaccaataaatgtacccttgggaaggggctacaactgaatatggattgtgaggacaagcaggcggctgggattgtggaaaagctagtcacactggatggcatataaattctgcggtcggcggccataaatcagcgtttggctgtcacccattttgccattttgccagtgtaaatcgcaggacttgctcctcgctgctcctttgccgcttcccccttcccgctgcctaaagacttgggctccgaaggctgggctctttaactggtcattaattacaaattatatgccactcctggcggcaggaacaaaatccttctgggctgtcagctgtcttgcgagtgtcgcccgacacacaaattaatgttgacaccgtcaccaggtccttcacactgctcgaaaatgccagctaaattagtcagaactgagtaatttcaactgtgattattaaattcaaaaattatagtattaaaatctttaataaaagtatgccaaaaagaacgtatatttaagggtatataatggtattattgtaatgaagcttttaattgaaataaatattttgtaatacattgaaatatattgtaataaatatatatattttcatgttattatcttagcagatacttggtggcttttgactagttcctaagttcttcttacatattcatggtttagtattgggatgcattttgattagaaatgataaaataaatatgaaaatgttagtgtacgccactcaatcacatttttcatccgcttagattattgattagtttgactatactatattctctgtgtagttcttcagattccggagttgagtggcggcttcgttagcgatgatgaagccgccgctgcacttcaaagacgcattaataattaataagattgtagccggggcaaaaaactgccgaccccggcgaattacttggctcag
PCR verification status
Line verified as correct.