ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
---|---|---|---|---|---|
VT44932 | chr3R 16694187–16696797 (2610 bp) | CG3822, TotA |
weak |
ventral nerve cord subset, brain subset | VDRC |
Annotations
stage | annotation term | intensity |
---|---|---|
4-6 | not active | 0 |
7-8 | not active | 0 |
9-10 | not active | 0 |
11-12 | not active | 0 |
13-14 | ventral nerve cord subset | 1 |
15-16 | ventral nerve cord subset | 1 |
15-16 | brain subset | 1 |
Whole-slide images
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Neighboring genes
gene ID | gene name | distance | links |
---|---|---|---|
FBgn0038837 | CG3822 | 2235bp downstream | BDGP FlyBase |
FBgn0028396 | TotA | 2571bp upstream | BDGP FlyBase |
FBgn0044812 | TotC | 4523bp upstream | BDGP FlyBase |
FBgn0038838 | TotB | 5473bp upstream | BDGP FlyBase |
FBgn0259215 | Ir93a | 8521bp downstream | BDGP FlyBase |
Sequence
tcccaatgcgtatggaaatgctgacaaggcttgcttgtcatggccggctcttaggcaaaataattttaataatgcagagtaagacatacacatgtgaaggttatgcccggagccatggcatttcatggtcaaaaggacctcaaaaatatttcacattgtgcataaatgtaaatacattttcgagcagttagtcattctccatccattcaattttaggaagggagtctcaggcaacgagcgatgaaagcgaaataccaaaagcaaaatatgagagtggaaaactgttgccgttggtcaagcatatgccatgcattttccatgtgaaacagcttacttcaaagaatgtaaatgcctggcttaactgtagatgtgtagtttcatacggcagtggccatattttacacaaaggaatttgttcgtccactttttgttcttcgctatgatttaccgctcaggcgaaaagctttgccaaatgaccctttccaaagtccatttgtttaaatcatacaaatttcaaaaaaaaaggaatccttttagtggcgcttaattaaacgttattcgctgcgcaaaaactttgatgaaatgcaaataaattaattttctctaatcaaagtgcagtaaacgcgtggaatatcaaataatttaaataattcaatggctgccttaaaactttagttataatgcgaactagctacgtatatgaaagctttgattgacaggggacgtggtaaggctgctttaagtggacccttgccaattaaaaagttcacaaaaaggcactcgaacacagctttcggtgagagctctcctgcactttgttttttttggagcacaccaaggacagtttattagtttttttttttttgagcattcggcaggcaatgatgtcagttggctgatgatgaggacgagtgacgcaattgaacaggagtggcatatgcaacaaatttgtaaggacgccatttaattccatgtcagctgcttggatgcctgagctgaatgaatggctgaagccccgaggacatgctcacaaatcctcagttcgaaggcgcctcgtttagggcttatactttttctttggcccgcttttataggcgcctccaaatccactttgtaagccattccagcggtaataaaggcgcaagtgagtgccgctaatataaaattgaatttaaataaatggagttggggccgtaaaaagccgaattctgatttgatttgtttggcggcgcacgcccagcacttaggcgccatttgatatgcaacaatctttggcgccaaaagaaaatcagaaaatcgaagggaatagaggggagcataatcatcatcatcaacatggggagttttgttctgtaataaatcttgtggaagaaatttagcccgaaatcgctctcatttattcatgccacgcgctatcgctgttttatgttatagaaggggattttttaggggaattgtttaaaaatacaaaggactgcacttgatacttaaaacatacacctaagtacatgcaaccttatcatcgattgtgactcaaattccaaagagtgaactcgagcctgcaggtgccgctttcattaataagtcgacaggctgttaggcagctaattaaagagtcggcctacaaattggcagcttgtgtgggccatgtgggaaagatttaggcaattagcaccagcagtacacccttccgagggcagcggggttgtgggacttaacccggtctcgaccctttcaccccccccaaaataccaacgattttggcagtcggtggaaattgtaacacctagctaaatgtagattgctgtcgcataccagcacaaaacatcttgctgtgtgtccttgtcatcctgcgagctgattgcgtaattccagctcacaagtgctgacaacggtcgggagtctgttaaaaatgtattatcattgcgattgccaccagatcctgcaagagtgtctacttattcgcagcatatatacccctggtatccactcgcaattgtttggctttaaatgtttcaattagccttggcggtacttaaaacaaacggtctaacttcatgtgagggagaagcatttaaatggaaatgtaaaagtaagtggattctttaatcttagggttaaaataaatttgtaaataagattaatatttatgttgtggaaaagaaacatgttaggctgtttgtgaagtaatacattttacagcttgcacctatcagttaaaagggtatatattaaaagcgaatactaaatgactgagaaacagataattaagtttagttactagcataattcgaaggtaaagttcgagaataaaattaattaaatttaatcaaattgactttgatttatattttagcttagccttatcagttaacgcagcttaacgatgtgcttctgttgttttggcacaaaaaattactcgatttgcttatcacgtataataagtatatgcaattctatggaatttgctgaacgttttccaatggctagcatattcagtattctaggaatatcagaatttatatcacctttcgctgagctataaattcagctaccaggctgctgggaaatcattccggtttgcttcagcgttccaaaaagtcataaccaa
PCR verification status
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