Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT45095 chr3R 17008469–17010637 (2168 bp) SNF4Agamma, Snmp1 activityactivityactivityactivityactivityactivity
weak
brain subset, ventral nerve cord subset, tracheal system broad VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14brain subset1
15-16ventral nerve cord subset1
15-16tracheal system broad1
15-16brain subset1

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0264357SNF4Agammaoverlapping BDGP FlyBase
FBgn0260004Snmp114543bp downstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0038866CG581017587bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0038865CG1082421656bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0038868CG586232332bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

gcccagaggtcaaccacagacaggcgacgaagcttatttgttgatgtggaagtatgtttatggtgcgagaagcctaattaggaatgtgtaaaaatacatattaatttggttatatatatagagttcacaaaggtatttgaatgcatttcgaatttcgagccaattctctattcattattattattgatatccagaaaaagtatatccttacacaatgcatatttatttaatttccttatttataatttatggaaatatgaaaattccttgcttaataaggtatgcttgcacatttattaaaacaacttaatatgcaagttaaaatatcttaaatagtttcttaaaaagttaattggctaaatgttagaattcaaaatatttcaacatataaattctgtagcattcaaaacatatattattttaacagatttttacaattgcttaatatgccttaggacgttgatgatttcacttaaatgtttagtaaatttaggtcaaaacggctagtaaataaatatattgtttcacggaaggcaacttttttttttttttttgtttggttgaaatcttttacgcgcttggtcacatgccaattggaaattaacatgccgctgttaacgcaatgttaattaaattcttctagactcgagattgtttttgaatcgatcgcacaactggcagaattccaatcaggcgcggaataatgctaaatggaactaagtcgaattgatttgtggccaaaaatgtaagatttggccacagttgcctggccaaaacccttaccctttcgagcaatattgcttcctttttgtgtttcgttgtggtttatttgccttccggcgagcagctaattaacgttaatgacttttacattctgtttgcgttttgttgtctggtcgcggagtctgttttgctagaattttatttacttactattagttttgcgcgcatttctctaacaaatattggcgctaacggcgaagaaagaaatattagaaatgaaagcgaaatacatacgtttctgtgaatttgcgaattttcaatggtcgtataaaggctaattatacttgtattatttacgtctataatatttgctgcttgtttgtcgtgctaaaaacaagttacaccgtcgcgggtaaacaaaacaatcaaaatacgataagaacgcaaaagcgcaagctgacaatattaagtatacgccccgaggtgtgtggaaatcagaagtttgttaaaaaattatcaattccttgagactcggtcaggtgttaagtctgaaagtatgagaattaaataagattgggtaatattttgacgggctttataaatttgcatcagtcgacggcagcacatttagtcgattgtttacttgctgtaggaaattaatatagatatctatatctgtgaacccttcatatctatgtcaatatgcggttttggccatcggcaattattagtgcggaaattttggtatgtcgagctgagttttatatttgctatagctaggatatttcctcgctggaaaacctctttttccagttttaatcagttttcattgtatagaatcgctggtcttctggtctcgtgtctgttgctttttaattgggtgcacctttcaatcaaagtttttgtcaatttcaattgaacggacacaagacagcaggcaatcaactagcaagagaaacacgcctcctcttaaatccactgaactttatggctgcgttcgttcaatcaacttaatgcgtcaccagtttgttctttcgaatgatcatgctttgtgcttatttgttaattaaaagagttcggggtcaaggattaatttgtggggtgatggggaaaggtgataagacgcggaccgctggaaataattatagctgctccaatgagattctgcgacattgtcgttatttcacttattttcccatttccttaaacacgaaaactcggcgaaaattcttgccgggtaattaaaaaatatacataaattggcattaccgcgctgggaaaggcagggaaatttacatagtttatgggtggcaatggcaaatcccctatatgcacttatcaaattttattttatttattacgagtaaataaaaaagcagaaaacaaaatgatataaatgtttaaaacggcacagtaaagcgcccctggcgttgagtagcgaaatca

PCR verification status

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