| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT45570 | chr3R 17918129–17920307 (2178 bp) | CG5778, CG5791 |
      weak |
ventral nerve cord subset | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | not active | 0 |
| 7-8 | not active | 0 |
| 9-10 | not active | 0 |
| 11-12 | not active | 0 |
| 13-14 | ventral nerve cord subset | 1 |
| 15-16 | ventral nerve cord subset | 1 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0038930 | CG5778 | overlapping | BDGP FlyBase |
| FBgn0040582 | CG5791 | 4579bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0038929 | CG13408 | 8935bp downstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0038931 | CG13407 | 11007bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0264491 | how | 13087bp downstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
gcatgcctccatttccttcctctttagctatcccactgcctgttgacttcctgtcgtcattagtgatgtttgcctgtcgccgcgtgacggcgcataaatatcaaagttagatttacaagaaatcgcattcaatcgcagctgaactgaactgaacggaactgagccaggcaggtggactaatagaattccagctgggtgaggcacttcaaagtgtccttgccacagagctttgttttccgctctttggtaagccggaaaatgaggaggctaaaatgtttgccgggtccaaaactaattagagcggaagctcagcaatgcatactgggtaaaacaaaagatggccaatatatatcacatatatataataatatattacttgttgagtgacatttgaaatgacaatattcaaaacgtaattgcgcgtgttgagctacaaagcgaataatgtacttatgtacatatatgcagtcagattaataacctcatgacggattatattaatggcatcattagattgcattttcgaaatgacatggaaaccataaaccagattttctttcattacgagttattttaatcaataaccaattaaagcgatccaaatgcgttgcaaaaagttataatttctggacagttgtgatgaacaagtaaaagttaatcctagtgttttctatatgatttgtattaacaatttctttttattttcttaattgtatgctttacgtgttttcacacatcctggcaggtccttgaagcggatttaaagaccacgggcatttgtgggacactgcctaacgcactcttcgcgttgtcaagcgccgtcgtcctggatgtcgcagatttgcgtacctcaaaggagacgcagacaaccgacgaggggcggatggggcatgacgccataaagataattggtcggcggatggtggggtgtttgctgctcatcaaaacgttaacgccctcacgtagtttcgctttaaacgcgaccaaactaaagtcgaatggccatcgaaaagggcgagttgatgggcagttgccagcgtattaattacttctggtggtcacttcgcatgcgtgtgtggtgtgtgtaattgtgccgcagccgaaggtcctgtatgtcctgcatgtgcttctcttccagtttgcagtttggggttccaccagaagttcgacgttaagcccagtctgcagcaagttgcctgtttggtttctcgcgaaaaaacaaaccctttttgttttggctgacacactggcagttcgctggagttttgatggccagcagcagctgttttagttgcgattaatatactcaaattgctggcagcttcagctgataattaatttaaaactttgcaaacggcgctcttccggggcgtgtgcattttgttttgcaacaaattcacacttttgggaaaaggatagctgccatagttggccatcaacaaattttctgggaaattggtctactacgctttggtattgcttcacagaaataatgatttcataaacttccataatgttgttttattttaaaatcaatcttaatttgagttctatcactttaaacattttcgattataatcgtttctgatgttgaataatatatcttttttctagcgtaaattttaaaaagttatctttgaattcaaattcaaaagacaatgctgccaagtgctgaaataatgtagcttatacacccaccacaacgtactaaaagcaactaaggattgaaacttggaagtaaaacgcactgtgggtctctgaatgctatgacaccgacgaagcttttggaagcccatcatggctgtcgtttgcttagtgatacgaaattagttatatttgaatacatttcaaaataacctttcataactatcattttatttaagaaagcaacaattttaaagtttataggaaaaactggctaaaacaaaatgtaatttgtaatgtaagaaatcggtataggttaaatttagtttagctattagtaagaagctcattaataactatgacagctaaaagctaataataaccaaaataaaagtgtataatgcaatgcaataaattctacacaattatggacttatgggcctaagctgtaactataattggctcactcacatcactccgcacacggacgtgacccatgtgaagctaatgaggagtttggttttacgcgagttcg
PCR verification status
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