Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT46771 chr3R 20222166–20224264 (2098 bp) nAChRalpha1, CG13616 activityactivityactivityactivityactivityactivity
not active
VDRC

Annotations

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0000036nAChRalpha1overlapping BDGP FlyBase
FBgn0039200CG136162683bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0039199CG136154575bp downstream BDGP FlyBase
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UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

cattattgcctggtgtaaatgcccctattaaaattgaatgcaacgcgaattatatcgaatttcttgggaaatatctagttatttcaagtatatcctataagggcattatgctcggcaactgttgagtagttttcgttactaatctcctcaaatattttcctgtgctttatctaagatttgtgtgtgctcacaagttcgttgtcctttgtaactgtaatcgggaaatgaattgtactggaattaaattcttttcgcttgctgaatgatcgatcggtgatggatcggcggttgcctcacaatatatatctatatatacaggtatgaactgcttcaactgcgtgcttcttgtgtatgcattgctgtgtgtgtgtgtgtgtttgggtgtggggttgtgtgtgtgtgtgtgtatgtcctgtggtggttactttagttatatacagaattattggtgagttgcctatatagttagtacttagcttcaatgttaacttcgagccccgatctgcatgatccttacgacccttacgtgactatagctccttcgcaaaggatctgttttccatttccgtggacacactgcgaaaattgtttgctcttaactagttcgtatatcattatactcgtactcatatcatatatagatgatacatatatatatatgtgtatattttctatatgttctatttgcatttcatttcgtcttatttgtggcagtatttaaattacacggtttcttctcgattacctaaattagcagcttaactcttcatatcaagcacactaaacatttagctagaaacctagggaaaacttgaacagaatcgattcgaaaaggcaaattcaaaatgtttgacattactagcataatatacagatactcgctaaattccatttaatttactcgttaatatttatgaatcaatgttgaaatgaactgtacaactataggtccgatcgatcgtgagtgggatcgacagaccgactgattgagtgaatgaatgaacgattgtttgcttgtctgtttgcttgtttgtttgggcggtgcgtgtgtttgtgtgtgtgcaggacgaaggaccggcacacccacacgcccacacacccacacagagtcaaacctatttgtttataacctaaaaacacaaccaatgagagcatatacacttctatgtatttgacgttaattcgattttgttttctcgagtgtcttcactattcacttttcttccttgtgttttgcattatttggtaaaacgagttttcatttatttctctatttatttagttttttgttttagtttggctttagcgtgtcgatttcccaagtgaaacaatttacaaaaatggttttttgttgaaatgaatttcatctaattgttcttccacgcatctcgcattttttcaaatttttttttcgcattttgcgattttatatttgcatagtgacattaggtttaaatatgcataaatgttttataggggttttactcatttagtttattttattcacagaaaagttacgccatttacttgtcattagttctttgttttcatttcgctttgctgcgtttaaatatatttaaatagttgattgtctaaaactataacaaaaggtttgttaagctggaaatctgtacaaaatagtttaaaattaagaagcttacagtaaatagtcgattcaacaatttgtatgcattcaaacaaaacttatatcagcacactaaaactatttgaataattcctaatgaacaaacatatttaaagcttaagcaagtgttaatttaaatttgtataatatttacaagtcacaccaaaaatggctgatattttttgcatatgattctgaagtttaagttagatattaacaaaataatagccaataacaaagagccaatgtatcgttattttacaaaatatatgttttatttttccatttggtaataccggtttgcccttttgctttaaactatttgttgtgtacgaaattttttgtaattcaattttgtcctctatgaataatttttgcaatcagttttttttttgcattgtgtcagtggttattcagttttgcattttaaaaaggtgtcatgtgttgcattcca

PCR verification status

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