Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT46773 chr3R 20224886–20226975 (2089 bp) nAChRalpha1, CG13616 activityactivityactivityactivityactivityactivity
weak
head subset VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14not active0
15-16head subset1

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0000036nAChRalpha1overlapping BDGP FlyBase
FBgn0039200CG136165403bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0039199CG136157295bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0039198CG57688826bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0039197CG1778014113bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

atttccacccagttccgcccagaacaagtccgaaatttataccattttcccgtccagctctttgccgctttttccgtgtgcttaaacagtgccacattcgttggcttggaaaactattttaattaattcacactaacaaatgttgaatattttcgattaggaattttaattaaacttttgccgcctcgcacgcacaactctgctgacgcagcagcagaagagaggcaacattcagacatttctcctggcaacaatgagcaacacccaggccgctcgacaaccctggcagtgggctcagggttgccgttgtcgcttgtcgcgacattctttgctaatagtttccacagatttcacttatgcttggcaagttattgttgctgtaatgtgattacactgagagaattgaaaagattgaatttaattgaaataaggtttggttttttaatattcaacaaaagtaagagatattcagattgaatctaatatttcagtttcagtgcttttccaatcgtgcgagtgtaagtatttgtttacttttttgttttttattaactcgcacacagcttcttatgcacacagcatggcaaattgcattccgcacttaatttgttgcatgccttgcggcgttgccacgccctctttcgccccaacaccgcccatttgggcgccgcctctgtcgaaaaagcagcggtggctcttgcatttgcttaatgtttactgttcttgttgctctagcggcagaaacttttccaaaatcaattaaaaatgcaaaggcataaatgaggggcaagcggggcgtgtgggcgtggcagtcaaccttgtggcaagtttcgtttgctttggcatttaaattgaaggtgttctctgtgtgccactcgaccggagccattggaatggctagaaaccagagccgagaacccagacctcagagctcagaagccagaactcggagctcagaacggtactcgcgtggcccgttgaaagtaattaaaaacttttattttaaattgaacttgccaaaggtttcggaacgctccgtatgctccaatgaatgcataatgagtgccgagaactacaaaggagctgcttaaataaacggcaagggcggagtgggtggttgggtggttgggaaacaatcaaaatctaaatcgaaatcaagtgaaaatggaattcgtattaaacgcaataatttaattgattaaaaggcttcaaactaaacaaatatccattcgctttagttattgttacttgtgtttaccgccgtgtctgtctgtttgtgtgcgtgtttttaattgaaattgttttgtgttttgactagctgcaatcctataaatacgtatacgtactctatatatatttatatgtatgcttgcacgatataatatatatttatgtacgcttgtgtgtgtgtgttggttgctcgtgtgtttagtaaaaatgtgtgactttaaaaatgtgacgacgactcgcttgtatcgacattcaactaaatttatttcagaatttcgcgcttcttacgagccgatttgtcggacctcgtgtttgttttaatattaaatttaattcaatactagatttgcttagctaccactagttacgacttattggctaattaaatatagtttatcgtatttacttcacttatttatgctaaaaatagattggaattcaatgcgatttaattacacccattctgcgtgggcgcatttcatcagtgttttgtttttgctctgctaaaaataatgcgaaaaatatgcacaaataaataaaccattaaaattgattttcttcttcatatgtatgtatattgtggcacgcacacactcacacaatctccagcagaagcacccacactcacgcactgaacacatgcagtcagatttaaatttaaaatgcaattttaaaacattttcatttgtttttgcttctttttgttagctttgttgctttgtgttgtgtggaactttataactaaaagatgtaacaaggaactttttggcgctcaaaaatacaatataacttacaaaactccatacgctttttacaacactggttcgggaaccacctaaacatcttcgaccacacaatca

PCR verification status

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