| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT48939 | chr3R 24405502–24407703 (2201 bp) | fkh, MRE23 |
      active |
posterior midgut primordium, yolk, posterior midgut anlage | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | procephalic ectoderm AISN | 2 |
| 7-8 | procephalic ectoderm anlage | 2 |
| 7-8 | anterior endoderm anlage | 2 |
| 7-8 | yolk | 3 |
| 9-10 | yolk | 1 |
| 9-10 | anterior midgut anlage | 2 |
| 9-10 | posterior midgut anlage | 3 |
| 11-12 | yolk | 3 |
| 11-12 | ventral nerve cord primordium subset | 3 |
| 11-12 | anterior midgut primordium | 3 |
| 11-12 | posterior midgut primordium | 4 |
| 13-14 | midgut subset | 3 |
| 15-16 | not active | 0 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0000659 | fkh | 1303bp upstream | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0262741 | MRE23 | 6268bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0263388 | CG43440 | 13708bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0026400 | Noa36 | 18279bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0001215 | Hrb98DE | 20054bp upstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
gccagccggggtaaaatgaagaaactccgccagaacgctgacagtcacaatgtcaaggaaaaatcgaaattgaagcgacaacaaacgaagcgccattttgttgtcgcttttgctggagaccgagacccagaccaagtcgcccatacgccaggtcccccaatcccacagtccccaatcccacagtccccaatcccctatcccctatccgccgtacccattttcagtccaatacaatccaataccgtcgacggcacgaccctagctaaacaacaaagcgaactctttatggaacatctccagtcggcttggaggctataaaaaatgtattaaagccagtccagtcgcccccacaggcacacatgtacatacatataaataaaatgtgtcgtatggacatatagaaaatggtgaccttctcgcttaattaaaagcgacaactgctcgtcaaacacgctcatgcccgagctctagataagcaataattttaatgtcttcggaatgtccgagaatcgtaggacctggatcgtagattcttccaaatgaatcacaccgattttaatcaaaaggtggtagtagttcgccagggggaactgcgtcggatcaggctctgttgggttatattgcagcgataaggtccattgcagcgatagggaaggtgctcgaactcggctcgtagtgctccatgaatattactagaaagcaaacagaggggagtcgagtcaagtcgggcagaagatatccactacccttcccgctctttttggccagagggatcgggctgggttgtgctggactgagatgggttagtcagtgtgtcaagtccgggcgggaatgggtcggtataggacggtatgggatgggctgggatgggtcccatgtcccatcctggttgtttgtttaccttcttgttccgttgcaatttatgagtgcacggcgataagggtttatcgtggcatggtagtggtggaaaactgcactctgcatctgagtgacggcgataagatagcgactcctggaactactcagctcagctatcggtcgttcaattcgaattcgctgcattgatagcgtcgatagcgtcgatggagatagtcagccatccgggcggcccaatcaatatataaatgattgttggaggtcagttgcttgagtcaacaaaggttgggaaatgaaaactaatttatggtactttttttcctttttcttgtatttcaaacattaaaatagtcgattttggttgtcgttgacgttgtgtttgttttgcatgatttataataatattaattttactagctttagagttggattttaattcttgcgttgacatttattgaattttatattgtgtattttacaataattttcatttgtttctgtgtctgtcagtgtcagtatgtgtgtgtgtgtgtgggtgtttatatttagactattttttatcaagtttaattaattagcttagctcaatgtaaaaatgggtctttgttttgtgtttgcaattggttttttatttttcattacgcacaatataactaatattaaaaattattgaataataattgcagtttcgctttttatgtgattttttttcatttttgttttttgctttcattatttatgctaattaaacgttaaatgctatacagtatttatatttatactatgtttactttcaagtggtgtggcataatttcatacaatttgattaattctcgagttagttaaaaattggttgcttgcaatgggtccttagttaaattgggtttcttggggagggggttgcttaaatgtatctatttatagattatttacaaaatgccttaatctaacgaattcgtacaacaacagaagacacataatgtaaatgaaatgcgggattttgcgatacatgggcgtatatcgatgcgcgtatatataaatggaaatttgttaaattattcagttaaaacgtgtcgttttcttatgcatggccagattttgttgcttagatagttgaagattcttagggttttgctggactgctcaatatgatgatttcggttttagatttctttttggttttgatcttttgcgattcgaattcgattgcgattgcctttggataaagggtttagtatttgtatctctctttttgggactgtttcatttggggctttgttttatgaaagaacattacacacgatcccttctttacatctcctctcc
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