Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT51935 chr4 1121258–1123592 (2334 bp) sv, Cals activityactivityactivityactivityactivityactivity
not active
VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0005561svoverlapping BDGP FlyBase iFly
FBgn0039928Cals14447bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0024913Actbeta15837bp downstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0087002Rfabg23360bp downstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0013749Arf102F23535bp upstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

gaccgattcagccctttccgacatatcaatatatgaaaatttcatgcagatagctttactacttagatgtaattaaaatttcatagtgccattaaattggaagtctgatatgtattctgatccaaaccaattatatataattgaagggcaaatatgaaatttcataatgcagcgctcataaaaatacatacaaaaaagctctaaaaatatgtaaggctctttcttaaatgagtttgctcacttttaagaagtttttagggctaagaaatattataaaataattctattctaattcaatcagacaatacattggaatcttttttagcttattgtgatgatgaattgttgcctcagatgttattgaattttaattgaattttaaaaaaatgttttttaaattttaaattaaaaaacgtatgttttttatcaactcatcaaatcactcgcgcgaatgtgagttttattaattcgacttggctattcatgaatatttataaaccataccctttcccgtgtccttttggtttgtaaatggaggtatatatgtacataggtacatatatgcatttgcagcgcaagttgtgcgtaattacgcatcatcatgccaatattttgggaacattttcatattttttctaggatatcgaaagattatgggaaataaaatgagaaaaaatttcaaaattgttcaaaagtgttttgcccgttttgtaggtaaaaggaggggtgtgggcacagcgttcttggtatagcgataaagttttgtgtcgaatcgatagaaatttacaagacaagtaggataatacggatacggaatatatctctttatatggtcggaagcggattcgttctgcctgttacatacttttcaatgaatctagtatacccctttactctacgagtaacaggcagtaggaagcgtttcccgcttatattcttgatcagagtcagaatccgagatctcaggaaatgttaaagctgaaaagattaagcaagcatcttcttaaatcatagacgcagctcatgcgttgccatgcccaaacattattgatatttttttataagtcttgtaaatttctatcaaattgcaaaatatttttggatgttgttttttaatttattatatttttcctatttctacttccactagttgagtatcagggaactcgactatagcaatctctttagtttttagctggatgttaagttaagttaagttaatttttaattcctaagttgcaatttttaacggcaattgattatcaaactttaccatagctttatttgatttctcttaattaggtcatggaggcgttaatcaacttggtggcgtattcgttaatggtcgcccacttcccgatgtcgttcgtcagcgtattgtggagctggcccataatggggtccgcccatgtgacatatcacgtcaattacgtgttagtcacggttgtgtgtctaaaatactttcaaggtaataaagcatttaagtcaaacgactttattgtaggttaataataacttaatttaatacaagaatgcatgtacttttttccttcgctaaatttgttgagaagtagtaggtttaaggaaggattttcaaccatatgaagtttataaacaattatttaatattcttgatattagtatatccgtccgtgtgtctgtccatatgcacctcaagatctcgacgacttttccagactggacagctgcggtaacaattagtgctctcaaatttttttaactcccttctatctgttacgtacttttaaacgcatctgttatggccttttacctaatagtaacggaaatatttaattcttgtataatgacataagaatcgtactcccataccatttaaggaaaactgcaatctcggcacaaatttatatacatatatttaatagaaaataaacaaaaaataaaataaatagataagaaaatatacgatatactcttaatactcttatatgtacgatatactcttaaggtatattatatataccttatttgttagagtgggtgtggcaacaagttttttcgatagaaatcgatagaaatttacacgactaatataattatgaaaatatatccaacaattcttcaaaaatgtgggcgtgtccacacggacagacgggcatgactagatcgactcggctattgatcctcatcaagaatatatatacattatatagtcggaaaggctttcttctgcctgttacatactttcaaagaatctagtatgcacttttactctacgaataacggatataattatatattgtcaagcatctattgtataccaaattaaattgcttcgtgatctaaatctttgaag

PCR verification status

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