| ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
|---|---|---|---|---|---|
| VT51937 | chr4 1124676–1126898 (2222 bp) | sv, Cals |
      active |
ventral nerve cord subset, brain subset | VDRC |
Annotations
| stage | annotation term | intensity |
|---|---|---|
| 4-6 | not active | 0 |
| 7-8 | not active | 0 |
| 9-10 | not active | 0 |
| 11-12 | not active | 0 |
| 13-14 | ventral nerve cord subset | 2 |
| 13-14 | brain subset | 2 |
| 15-16 | not active | 0 |
Neighboring genes
| gene ID | gene name | distance | links |
|---|---|---|---|
| FBgn0005561 | sv | overlapping | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0039928 | Cals | 11029bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0024913 | Actbeta | 19255bp downstream | BDGP FlyBase iFly |
| FBgn0013749 | Arf102F | 20117bp upstream | BDGP FlyBase |
| FBgn0039927 | CG11155 | 22552bp upstream | BDGP FlyBase |
UCSC snapshot
Sequence
caacatcatcgtagaattttggccgtgccacgtggcagttcctaagtcgacactgtcccacattgctattatttacgcgcatccactttgaccataatttatgttggtagcagtcaacgaggccaacgagagcagctggaaaacctttaatcccatgttttatttgaaattagctgaaccctgtttaaatgtaaattttatgaaattttaaaaatgttaaagcccaaatagccgaacgtcctaaaaacatgtaattacgaaggtttttcttcaatcttacgattagtcgttttggaactatggaatatggttgtcccgtgttactcgtacctgttatggctttcaaacaagactagtttggttaggaacgaatatggacccttattataaaattttttcgaagaataatgttacaaaatgttctttatatttaacaaaaagcatacaagtcattatctgttgatcgagtatttcaaatgtcaagtctcatctctattctgcatgctagaaaatgtaattttaattttaatttttaaccgatctcaacacgtgcagttataatcaattcgattcgtgttaccgccgggtcccgcaaaaagtaacaaacgtctagattggcatgtggccgctggtaatgcaaaagttgcgacggacaagggtaattcatggtataatcaaggaggaagaaaaatttcataatgcgacaatgtgtgatgtgatggcacttgaacgatgattagggtggcggtgattcaatcgaataaaaattgtgcgtacggcggtgccaggactccccttatactgattcccaggagactgtcacttaataaagtgactttcatagcactcaaccaattttagttttcagccctccactcaaatacattgaaatgtccatgaagcgggatgtacttttcgcgcatcccaaacatatgtctcaattgtgtgcactgtcgaaatatccaattgctcatcccgtttcaagctggtactcaaaaatatataaaacctgaaactgttgtcttaagggcacaaactaggcagagttaacttctgcccttacaaccccctgtagcatatggtaaccttaacaatctgtaaaaaaaacctaaaagatacttaaatcaatgctatcccggaggtcctatgagttttaataggtgtatttgggtaccgcattttgtaattattaaagtttattgcaaaattgtacacaaatactaacacgacacgtttggcatctcttgaatatgcagggtgtgtgctggacagaaggacaagccatgtccatgtatggactgaccaatattatttatatatctatattgcctcgggaacgcttttttacttgttacaacgaattttactttctataacattttattatcgtattagtataaaataataatacgataatattacgattacgattagtacgatctttaaaaacttattacatagttttgatttatatattttgaccacaaaaggcctgtaagacttagtagagccaccaaaactttaagtataagtactgaagtcataattagagattataaataacaatgatttacctacctaccctcatgggtaggtgattttaagtaatatgaacgttaaagtgttcatggctaacctggggaacagtcacttcttggatatctccatcttccttgcaagaagtgcaaggggaaccatagtggtctatcctcttttaaatattatatgtatgtacaactgattgtttattgtagttagttgtgtacaattgatttgttgataagtatgtaaaaagtagaagaaaacgttctgacccaataaagttcttataatcttggttaggatcacttgccgagtgattgtggccatgtccaaaactgttaaatatataattcttttctaactttattacaagactatttctgatccttcgctaacaaaatgttgaaattgggtaagggggatctgatagagactaggaactattgcggttcctattattttttagtaggcttaaataaaatttaccatttcccttctaaccgtgaagagcgttgattttatttaactaagtcacttaaaatcttttcacttaatttcagaattgtaaggaataaagccgccgagaaagccaaacacgtacatcatcaccagcagcatcatgtttctcagagtctgggtggggggcatattgccacggaaagtgttgacagcagcacagga
PCR verification status
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