Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT6437 chr2L 12590506–12592674 (2168 bp) nub, CR44595 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
hypopharynx, pharynx, hypopharynx primordium VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12hypopharynx primordium2
13-14hypopharynx3
15-16head subset2
15-16pharynx3
15-16midgut chamber2

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0085424nuboverlapping BDGP FlyBase iFly
FBgn0265806CR445956957bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0265807CR445967649bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0265808CR4459718901bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0265809CR4459819350bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

aagggctgcgtacctgatatttggcacattagcaagtgtcttcttaagtatatgtttattaactctaaaaaagtcatgacatttattccattattattatcattataaatacgaaatttattgcacatatgtagaaactaaaacagctaacttatattttatattttatgattgcatcaccatatattcttatctataagtcgagtagcgaagtgcagtataagccaaatatcgcaattccaagaagcacctcccgttttatagatcttgacttggctaaaatattgtgcttcccccttattgacctttttcaattcctcacttgagacttctggcacaagtcgatcagttattaccacgtgataccacgtcgatcgacgtctgttcttgaggacccgtctgccaataatcgaaggcaataagaattcaacgtgacacaagaacaaaaccgtagtaataataaataaatttgtcacaagttaaaaaagcaggaacaatgaatgccattcattagtcaattacagtaagacttggctagttaacaaacacagacggttatcaagatagaacccggcgataccgcgaaatggaaatgagtcaaaaaacaggtgccaaatgggggaaatgatgatgtctagatagaaagacaaataatttgtttagaattaggaatttggggctccggcgacaaggcaatcagtaaagtgtggctaattaatattgagctgcaatggggttaatttgtcttagtttgtaagtcacaaattgtttaatttagtgttgaatattcggtgcctattttcattttttttttttttcgtggagcagagctaagccaacttgagccgcaggaaatctctctttggcacataacgaatggcgccccattattcataaatgggaaatattcagacccccttcgatatgtgaagggtgacagaaatcgatgagggacctcttctatttgcctacgcattaaatgtaattaattttgtaaattccgctaatacacatggacttgccactaaacttctattagcattttaagaccacgagttaaaaatacgcttctattaattgtcaatttttgtacgattttatccacatatttctgactttgctaagccttctgctgaaattgattagctaggcaagcaaaaataaatattcgcgcgaaatgtattttagaagaggtggtgcagacccacccataatgagtgccaaggcattgtcacacttgggtaaaggtcatattcatacccatatgtagacctgttccacgcagcttatcattatctacatacaactatggatcgtgtgtcaccgaagtatttgctatgaatttacgattcaaagtatccacggctatgacatgattgaaattaaagtgagctctgactacatctgatattttaagcagttacgcgttctaacttatctataaattattaggttaaatataaatatttaagtttaaagttgcttactcgtttacctcaaacgttttgattgaaggaagtacagtacactagcatgttgaatttctaatcaattcgttttaattttaccttataatatataatgatgtttatatctcacaagtatctaatgtactgaggtttcccccgcttaaactgtaaaacgtctggaaaaaacagtttgttcccatttgacaccaaataagtttcgtaatacgcttatagggttaaatgttgttaaatatttaacaatgggacggagtgaaatcggccgcgtcactttccacatttccgctgcactcggatctagatcgggattgggcactctttcgactttaataatagaacatgacttggtttaacaaagtgttgctttctgtacgcacatttaaatggcattagcaattattcgtgtttaggccctatgtatgaatgaaaatttgtatctgtcggtgtttattgtctgattattattttatttctatgcgattgcccccgccgccaacatggctactgttccgtctattcaacttagtctgcttcttcttttgtggcttaaatggtcaaaaacatcaggtagatgacttgtaattacgttgccaagatcggagtctgtacgggtatctatgttgtagttggggaatttaatgcgcccaaatcgatggggagcttgtaaatatcaactaatgca

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