Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT6438 chr2L 12591852–12594265 (2413 bp) nub, CR44595 activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
hypopharynx, pharynx, hypopharynx anlage VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10hypopharynx anlage3
11-12hypopharynx primordium3
11-12clypeo-labral primordium2
13-14hypopharynx4
13-14clypeolabrum2
15-16pharynx4
15-16midgut chamber1
15-16salivary gland1

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0085424nuboverlapping BDGP FlyBase iFly
FBgn0265806CR445958303bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0265807CR445968995bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0032439Ref218665bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0265808CR4459720247bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

cgattcaaagtatccacggctatgacatgattgaaattaaagtgagctctgactacatctgatattttaagcagttacgcgttctaacttatctataaattattaggttaaatataaatatttaagtttaaagttgcttactcgtttacctcaaacgttttgattgaaggaagtacagtacactagcatgttgaatttctaatcaattcgttttaattttaccttataatatataatgatgtttatatctcacaagtatctaatgtactgaggtttcccccgcttaaactgtaaaacgtctggaaaaaacagtttgttcccatttgacaccaaataagtttcgtaatacgcttatagggttaaatgttgttaaatatttaacaatgggacggagtgaaatcggccgcgtcactttccacatttccgctgcactcggatctagatcgggattgggcactctttcgactttaataatagaacatgacttggtttaacaaagtgttgctttctgtacgcacatttaaatggcattagcaattattcgtgtttaggccctatgtatgaatgaaaatttgtatctgtcggtgtttattgtctgattattattttatttctatgcgattgcccccgccgccaacatggctactgttccgtctattcaacttagtctgcttcttcttttgtggcttaaatggtcaaaaacatcaggtagatgacttgtaattacgttgccaagatcggagtctgtacgggtatctatgttgtagttggggaatttaatgcgcccaaatcgatggggagcttgtaaatatcaactaatgcacagtcaaaaatttctatgactttcatattaggttgagtattttatttatatttacttatatatatttatttatttattagatatttttacatatttcctttcggttttgatttactaaaagtcatatttgaatattattcgtaatataaaagctttatttttattgctagaaaattttaatgttaaataacttacgctcaattaaccaaattaaaagtttgtcaatgaaaaagtaagaaataatatatggtgatatcagcttaatgccttccttttaaatgtattttgtaaaattttggtagaattttgtgtttcagtgcagtgtatctaaaaaatatttgcggcttgcgatcatgaatattcagttcgattgccgctaccgttgacaggcttagtcaactgtttaggccaccttcatcccctcccgtatgcatttggctgataagctaagcaaaagtaagaatgagttggcgttaacaaattttaattttcggccatgtcacgttgatgccttgtcgccaagtgaaatttcaaggcaatgttccgatttaaccaaagcaacataaaccaaaaaattgaactaattaaaatgacaaaaaaaaagggcgagataccaagaaaagaagaagctcgtgaggggctttcaacctgcagataaacaggttcacatgtccatcatactttgcgtgcggaatgatgagtttgcataaatgagttttcttcgctgctcgtcttctaagctgaaaatgcgatttgagctctttgaatttctaattgttgaggcttttggttcgcctagaatttcctattcctcgaattatatttttgtaaatttatttattaccatgacaattgctttgctataatttatggcactcccatgcccaagcaatgcctgccacccccgccacgccctttatggctaattaatcttctttggctaattacagaccagccttcgtccacttgaccaacttgcggctatcggctctaatcaaggttcctgaggtgtttttcgagaaccgttttcaactgctatctgctccggagagtgattacctatgtgttctttgctgttgctgctgttggcacagttagccgtaaacactgattatgccattgttgctagcaaactactatcagcagcaacttcagcaacggcagcagcgtgttgctagcaacaacggcatgttacttgaatacaaaagccattgcaatacaaatcggggcagcaacaattgcagcagcaacaacagcagcagcaggaggaacagcaacagcaacaacaaccagcgacagctgttcgcagcggaagcactaacaatgtcaacgccgacaacaacatcgaaatacaaaatcaatggcgaggccaccgaaggcgtttcagcatccacactgctgtatcatcatccgcatcacagccatcgtcatcatcaccatcagcagtcgcaacagcagcagctacatcagcagcagcagcagcagcaacatcatcatcagcagcagcaccagttgctgctgcagcaacagctccttcagcaacatgtggccaacagttcaccactgcaacatctgagcaatctgtttggcc

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