Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT64948 chrX 20634885–20637096 (2211 bp) shakB, CR43838 activityactivityactivityactivityactivityactivity
weak
head subset, peripheral nervous system VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6not active0
7-8not active0
9-10not active0
11-12not active0
13-14not active0
15-16head subset1
15-16peripheral nervous system1

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0085387shakBoverlapping BDGP FlyBase
FBgn0264390CR438382906bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0265921CR447104233bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0052507CG3250716292bp upstream BDGP FlyBase
FBgn0031130CG1545217894bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

tctaatcctctcccgacttgcgatttcaatcaactgcaacagtgcgtatgaggaatgcgatttaaagccaatgtgcagaaccagaaaatgtttttttttacaaatttaaattgtttaaaacaaaagcatgaaataaacaataaattaaattctcttacatatttgtgtgtacaccacatgctctattatgttgttgtaatacaagacagtgctaagcgtaaatggtttttcgcccctccgatgaaatgaaagccattggatatttatgtatatttcgtaacaaatcgaaaattgtttttattactttctgatcaaaatcatacaacgttgtcaattcgttttgttgattactcaattatcgcattataataatgtgtttttggtttatgtttggttttgtttgattttttttttgtgtttttcgtttttttcgtttcgtatttttaatcttgtctgtttttggtttttacgtttgttgcttgctttaataataatttataattataataatttatataataatattttataattttacttggtaattattaattcccatcaacgtccatggccttttgttttttgttggaagtaacgagggcggggagttgctcggggagagagtaccacccgcccctttcttccgactgggctcttttgctttgctttttcatttgcttttgcctttgcctctgcctttgtttgtctttgcctttactttacttttaatgcatatgatttttggttttatttcttcgttcttcttctttgccgcgttttagttgtatttcattttatgtaatgcgcctgctgcaataattttagtttgtaaaattaactaatcgtaaaatgtgtgtatgtgggcatgtgtgagtgggtgtatgtatactgatgtgactgtctgcggtctgtaggtgtgttggctgtgtgtatgcgtgttatttacaagtcgattttttgttcagtgtcttaaatgtaaggtgtcctcgcctccacttccgtttccgcttagtactcactcctcctcgctttattgcataattttattattattggtatttgttttgctgacgtatagaatatatatatatattctatatatatatctgcataccgcccttgtgtgtgtgtagttcgaatatgaccgcctgtgagtgtataatttattacttagtctgctaaaaattcacgtttatatcctcaatataggggctttatataagtgtatgccatgtactgtatatagatttgttttgcctcctcatttcctcctccgatcggattgattcgagtagtacatatgtatgtatgtcactggtattatgcatatagtatatgtgtgtgtatatgtatggcgatcggggcacgtgcgcatatatcggacgtgcatatatatcgacggatatcggatatatgatcacatgtatatgttcgcggctccgatctatactgcctggctctcccctctcgctgtcgttatcgtcatcactatcgctatcgccatcgttccgctttctcttccgtttgccatcaataataaattgattgttaaataatttaaattgtatattacttatatggggccttaagacctaatccgtactgcctacgtgtttcgtttcgttcgtttcgtttcaagtttgtcgtgtcactcatttgaaaatttataaactgaggacgtttccttgtctgtatgtgtctatttgtgtgtattgcgtcgggtgtgtattagtgtgtgggtatatatatatatatatatttgcgtatatatatatacctatatagcttcaaattaaagctttattaaccatgctcgcgttttgttttcgtattaacaaaattaaacgttcgtaataatcgtactcaagactcaataatcgataatcataaattacgataactgcacgttataactagttaaatgtccattaccgtttatcgttaccgtttaccattacctttaccgttagcataaccatacaagtacaagtacaaaaaaaaagattggatctactacatctctatcgacttcgatcgattactatcgatattcagcgacttacactcgacatcgatccactggctagttgtatgcgttatctgaattattcataggtctgtatatctgtataattatgctatgtccatatacctagatatatctgcgtgtatataagagatacaaactagaagtacgcttaacgccttaaag

PCR verification status

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