Fly Enhancers @ Stark Lab

ID Coordinates* Neighboring genes Expression
(4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16)
Strongest annotations Order
VT7346 chr2L 14382957–14385160 (2203 bp) ppk, elB activityactivityactivityactivityactivityactivity
active
dorsal ectoderm AISN subset, procephalic ectoderm AISN, hindgut AISN VDRC

Annotations

stageannotation termintensity
4-6dorsal ectoderm AISN subset3
4-6procephalic ectoderm AISN3
4-6hindgut AISN3
4-6amnioserosa AISN3
4-6ventral ectoderm AISN3
7-8procephalic ectoderm anlage3
7-8amnioserosa anlage3
7-8dorsal ectoderm anlage subset3
9-10not active0
11-12not active0
13-14not active0
15-16not active0

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Neighboring genes

gene IDgene namedistancelinks
FBgn0020258ppk1786bp downstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0004858elB7671bp upstream BDGP FlyBase iFly
FBgn0015546spel116118bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0001970Pgant35A21547bp downstream BDGP FlyBase
FBgn0266428CR4346321655bp downstream BDGP FlyBase

UCSC snapshot

UCSC snapshot

Sequence

tgtgttcatacataaaggccacactcacaaaatattaatgtacaaacgctttttgaaatggcacaaaaattcaatggtctgtctgcatttttaaatattttttgcttttgccttgagtgtgtgcatttgatggaactgtaattaaattggcgagtgcttcgaaacgtcacgacagtttacatattttagcaattctatttgaataattcatgcttttcctgtgggtgggctaaaaattgtcggaattaccctttgaaggtccaattcgaagctgttgaagagctgtacatgggtcaactacttttttttttctagccggcagagatattcattaaacatttacagtggtcatgaaaatgaaaaagtaagaagtggaaatagattaaatattgcacacaaagccatggaattttctatcgaggtttagcaataacaatttattcgttcctgctttgtttgatctgtttttcaccattttaaagtgtcgtatattaattttttttaagtattattataccaaaagttagcccttattggcaataaagtaataaatgctatatgatcaatacttacagtttttaattctattacaatagcatcaaatcgtttgtcacaatcatttttacccagatttttcgattgcagctattgtatcataattaataatttgcataatgctctgactttttcaattgcacttgtgccagttgactgaagagcactggcaattatatatggcgtcataacacacgttatgatctcatcaattcaggctgcttgccatcgagggcataactacgagcattcataaccacccagtttcgccttatgtatatctgcccccatccactctggatggatggacggacgactgttattcccttgtggcaagcaaggaccactctgccaacttggacgattcgcatttgtttataaattatgaggcagggacaacagagctgactgcagctgctgatgagtagagttgagttggctggaaaggccaggaaaggctgacacgctgctgctcactcctcggcggctgctcggtcagttttctgtaataaatcaaaaggagtttcgccagcaaatcctctgtcttggcctggagtctgtctgcttgatgtctacctgtctgatgatgtgccgtgcagttgcagttgcagttgcatttgcagttgcagtctgtggcacttgcgagctgggaaaatttatgcatggcttcacatttcttcgagttatcatttgttacctaaattatgcatgttgagttgcaggttttgttgtggaattactccagacgattagccgacccaaggctaaatgttcactggaatggctgttgatgtcagcttgcaaaattacaagttttgcgcccattccacattgccaaatgcattcaaattaatgcccatgtatgtatgtgataatgctaatcgaatatattataactttggctcgactaaacaaaatttcaattatgaaaactgaccaaacaagacatttattgtattatcccttcgggtatccttggcacatttgttgcgataacgttcggtagctgcaaaaatcatggaatataattaaatgtataatttagtaagcgattctatccccaagcgcaaccacaacaaattgtttacaaatggtccacgtttaatgtaaattgttgctcacattagttgccgcagattttcgctcatgattatcctaattaaaagcgtaattttccaccgcatctgctctttttcccgtatatgtacaaatatatgtacacttattgctttggcaccataagtttggtaataaatgtttggatttagcttaaaaagttttgcgttaaagttttgcagtagctacaaatgctgtttaattaatgaaattatttattctactgaatatgcaattcttttttatttaaaaatgtataattatattgctctttggcttttgtttttctttgttagaagatacatttaaatactctaagattgaacaacactagttgacctgcggaaacattgttatactttttaactgctaacaacggtggcaaatatccagtgcaaccgtgtgcaatttattaaccggacaatcctaagtcattgccatgacgtttatggccggcacacagggtagaaaatggtgaattaaaatcaactagtacttagttagatgcgatgtcggttcgtataaacaagtgc

PCR verification status

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