ID | Coordinates* | Neighboring genes | Expression (4–6, 7–8, 9–10, 11–12, 13–14, 15–16) |
Strongest annotations | Order |
---|---|---|---|---|---|
VT7847 | chr2L 15331388–15333912 (2524 bp) | esg, nht |
active |
dorsal ectoderm AISN subset, posterior, ventral ectoderm AISN | VDRC |
Annotations
stage | annotation term | intensity |
---|---|---|
4-6 | dorsal ectoderm AISN subset | 4 |
4-6 | anterior endoderm AISN | 3 |
4-6 | posterior | 4 |
4-6 | ventral ectoderm AISN | 4 |
7-8 | posterior endoderm anlage | 2 |
7-8 | procephalic ectoderm anlage | 3 |
9-10 | posterior endoderm anlage | 2 |
9-10 | ventral nerve cord anlage subset | 2 |
9-10 | amnioserosa anlage | 3 |
11-12 | not active | 0 |
13-14 | not active | 0 |
15-16 | not active | 0 |
Whole-slide images
Neighboring genes
gene ID | gene name | distance | links |
---|---|---|---|
FBgn0001981 | esg | 2478bp upstream | BDGP FlyBase iFly |
FBgn0041103 | nht | 12488bp downstream | BDGP FlyBase |
FBgn0032563 | CG15258 | 29533bp upstream | BDGP FlyBase |
FBgn0028852 | CG15262 | 32022bp downstream | BDGP FlyBase |
FBgn0264264 | CR43764 | 33690bp downstream | BDGP FlyBase |
Sequence
tcctgggaattactgtgcaacggagtgatctgcatctggatcggagtcctcacaggcacagcagtcgccctgccacagggacaaatgcttgataagaacgctaattaagttaaatgccaactgtgtgtggtttctacactgaaaaaaatatgttgtaaactgtatagcattatactgacatgctgaaatttcatgcatgcttatagtttttatgttagttgtttaacaattagtatttcatttaacgtatttaatttctatgcaaaactattacaaataactttcttccttaataaatgaatttgttttcagtattgcggtgattccaggtaagtgatcagaaattggcgtggtttgcttccctttgatttatgtcctgccattggacatcggtcggtaggagggggccacacctactatcttatctgtcgggtgaacactttcgctgtttgtttgtttgggtgttgttgccacacatctgccacttcgtgtcgagcgtgcatgtgtgtgctggtttccacttgaggatctcgacgtgctccttaattgtttaccagttgtttactacatggatcctttccctcccgcaaatctcaagaacgcataaatatgtgtattttgaaatcgcttctatggactataggctgaaaggtacctttttgtggccaaaaaagtccgtaatattaagttttgattacgtcattatgttattataagattagactttagtgttgcgtaccagaaatttaaaaaaaaaaaaaatcccgcacggttaacataatcgacggcagggaatattaaattattaatcgagaaatcccctgagaaagccaaaatttcattaataaatcagcatgtcgcggagaaaatgtctgccaacgacgtgcatttcccttattttagatcaaaatgtaacaaagaacaatatattagggagttaacaaaaaataaacattttttcctcgtgctgcaaataaaaagaaagattgccgattaaataattctttagtgtctggcacgaaagcagaggtgcctttacaaagtttgcttaaccaaagtttgcttaactttgcaagaagaaggcctattaagagtacaaatcaaaaattgatcccaaaaatgtctttttacttaaaagatatgtatttattttggtaacaaaattaaatataaggggcggaccacgcccacaatttttggtatcgtaaagatatagcctagtgttacccaataaaaaaaaaaacagaaactaaatatctctctccgttttgtcaaaaaggtacaattcagcctttagtggctttggcgcctcaaacgtttttcaaatcgaagagaaaatttcgagagcgaaacagaaacaaagtggaatcgaaacagtgagagtgaagagaagcaattggcttaaagagaatgcttatgctctttttcgtactgaattttagcttggctctttctaaacgttctagttgtatatttaccgtattgtatttctgagaaattttcctatttttttaaaattttttctgggtatttggacaaaatcgaatcaaatccaagtcgtaaaattctcgccaattcgattaccggaacatgcccgcagaaaaaaattctatatcattatctaatgatgaattacagaataatcatattagtacgccgaagtagtaaagctattaatttattataaatattcctaaggatccataatgaaagatgttaatatatttaatattgtttacttataaacggggaatacaatatttctaaaactttttacgcaaaatcgattgaatattggttacttttgattccgtacaataacatacttgttaataaacaaatttagtgactacaattactacgttcactcctttctcctgccaaaaaacattttattgatgcagaagtctacctgctcattaatgcatcgccctgtgtcctaaaaatgttagtattttatgttgggtacctgcccatgttttttgcgtttcagttattaagtcaactaatgatgcacctgataatgataatgaggtaaaaggaaacccttgttcgctaatcctccaaaagtggggtttttcgaatttctagttaaatttctaggtaagatcatagatctccttattgcgcattgaatgcaaatgcagagaggacgagagagagcagctgcggagagcacgatgcacacaggtaaacatatttgaatatatggcccacactagagcaaatataacggcatcgcttcgtttgcggcttcgattggtgcaagtgtacgagttcggcacgtgaggcaattctacataaacaaggcgaaacctgtttagccgagtgccgcgattggtcgacgcatatacctgaatgaacatgcatactctcggcggaacgcccgagagagcgttctcttttggcagcttcgtgtaatgagccgagtgccgagtgcaggggcagtataaaaaggccgcaccaccgccaaactcgctcagttattcccagactctaaccgattcacataaccatctctccca
PCR verification status
Line verified as correct.